小鼠盆腔器官脱垂模型阴道组织转录组分析

研究通过双侧卵巢切除、宫颈牵引和反复阴道扩张在雌性 C57BL/6 小鼠中建立盆腔器官脱垂模型,采集 POP 组与对照组阴道组织进行 bulk RNA 测序,每组三个生物学重复

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE347412: Transcriptomic profiling of vaginal tissues from a mouse model of pelvic organ prolapse

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

小鼠盆腔器官脱垂模型阴道组织转录组分析

Transcriptomic profiling of vaginal tissues from a mouse model of pelvic organ prolapse

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为 Transcriptomic profiling of vaginal tissues from a mouse model of pelvic organ prolapse。研究通过双侧卵巢切除、宫颈牵引和反复阴道扩张在雌性 C57BL/6 小鼠中建立盆腔器官脱垂模型,采集 POP 组与对照组阴道组织进行 bulk RNA 测序,每组三个生物学重复。数据可用于识别 POP 发展过程中参与盆底组织重塑的分子通路,支持转录组表达谱分析与差异表达研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):盆腔器官脱垂(POP)是一种常见的盆底功能障碍,其特征是盆腔器官下移以及盆底支撑组织的进行性重塑。为研究与 POP 相关的分子变化,我们通过联合双侧卵巢切除、宫颈牵引和反复阴道扩张,在雌性 C57BL/6 小鼠中建立了小鼠模型。从 POP 组和对照组小鼠中采集阴道组织进行转录组分析。对 POP 组的三个生物学重复和对照组的三个生物学重复进行了 bulk RNA 测序。该数据集提供了与实验诱导的 POP 相关的阴道组织转录组图谱,可能有助于识别 POP 发展过程中参与盆底组织重塑的分子通路。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:泌尿生殖系统疾病/盆腔器官脱垂。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347412

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 20 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

盆腔器官脱垂(POP)是一种常见的盆底功能障碍,其特征为盆腔器官下降及盆底支持组织的进行性重塑。为探究与POP相关的分子变化,我们通过联合双侧卵巢切除术、宫颈牵拉及反复阴道扩张,在雌性C57BL/6小鼠中建立了POP模型。收集POP组与对照组小鼠的阴道组织进行转录组分析。对POP组三个生物学重复和对照组三个生物学重复进行了bulk RNA测序。该数据集提供了与实验诱导性POP相关的阴道组织转录组图谱,可能有助于识别POP发生过程中参与盆底组织重塑的分子通路。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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