不同胎牛血清比例培养的布氏锥虫血流型转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org，包含布氏锥虫（T. brucei）血流型在含不同比例胎牛血清（FBS）培养基中培养后的转录组数据，用于研究铁感应机制
基本信息
资源简介
不同胎牛血清比例培养的布氏锥虫血流型转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org，包含布氏锥虫（T. brucei）血流型在含不同比例胎牛血清（FBS）培养基中培养后的转录组数据，用于研究铁感应机制。数据分为两部分：第一部分比较 10% FBS 与 30% FBS 培养的 SMB 细胞，各 4 个生物学重复并含染料交换；第二部分比较 10% FBS 与无 FBS（补充 5 mg/ml BSA）培养的 SMB 细胞，各 3 个生物学重复并含染料交换。该数据可用于分析铁可用性变化对锥虫转录水平的影响，探索转铁蛋白受体表达调控及铁感应相关通路（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：血流型锥虫对铁饥饿敏感，当置于低转铁蛋白或缺铁培养基中时，会上调 ESAG6/7 转铁蛋白受体（TfR）的 mRNA 和蛋白水平，并调整 TfR 表达以补偿内吞作用减弱。这两项观察均提示存在由铁感应机制引发的特异性转录水平响应。分析了在不同比例胎牛血清（FBS）中培养的 BSF 的转录组。第 1 部分：使用在 10% FBS（正常条件）中生长的 SMB 细胞的 4 个生物学重复和在 30% FBS 中生长的 SMB 细胞的 4 个重复，以及染料交换。第 2 部分：使用在 10% FBS（正常条件）中生长的 SMB 细胞的 3 个生物学重复和在无 FBS（但补充 5 mg/ml BSA 以模拟含 10% FBS 培养基中白蛋白的生理浓度）中生长的 SMB 细胞的 3 个重复，以及染料交换
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-1530
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-1530
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
血流中的锥虫对铁饥饿敏感，当置于低转铁蛋白或去铁培养基中时，会上调ESAG6/7转铁蛋白受体（TfR）的mRNA和蛋白水平，并调整TfR表达以补偿内吞作用的降低。这两项观察结果均提示存在由铁感应机制介导的特异性转录水平应答。对在不同比例胎牛血清（FBS）中培养的BSF转录组进行了分析。第1部分：使用在10% FBS（正常条件）中生长的SMB细胞的4个生物学重复和在30% FBS中生长的SMB细胞的4个重复，以及染料交换。第2部分：使用在10% FBS（正常条件）中生长的SMB细胞的3个生物学重复和在无FBS（但补充5 mg/ml BSA以模拟含10% FBS培养基中白蛋白的生理浓度）条件下生长的SMB细胞的3个重复，以及染料交换。
第3部分：使用了在10%胎牛血清（正常条件）下生长的3个SMB细胞生物学重复，以及在无胎牛血清（但添加了5 mg/ml牛血清白蛋白和0.3 mg/ml牛全转铁蛋白，以模拟含10%胎牛血清培养基中白蛋白和转铁蛋白的生理浓度）下生长的3个SMB细胞重复，同时还使用了染料交换。
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