系统性硬皮病基因-疾病关联数据集

该数据集来自 scielo.figshare.com,配套论文发表于 Brazilian Journal of Nephrology(2019 年),围绕一例硬皮病-皮肌炎重叠综合征患者的硬皮病肾危象(SRC)病例,包含 2 个图像文件,展示肾脏活检相关图像资料

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2023-06-02 更新
浏览 2
医学影像Scleroderma, LocalizedThrombotic MicroangiopathySystemic SclerosisHypertensive RetinopathyEndotheliumComplement Activation
Systemic scleroderma — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
医学影像
大小
0.00236315 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-02
版本
v1

资源简介

系统性硬皮病基因-疾病关联数据集

Endothelial lesion and complement activation in patients with Scleroderma Renal Crisis

该数据集来自 scielo.figshare.com,配套论文发表于 Brazilian Journal of Nephrology(2019 年),围绕一例硬皮病-皮肌炎重叠综合征患者的硬皮病肾危象(SRC)病例,包含 2 个图像文件,展示肾脏活检相关图像资料。源站描述涉及血管内皮损伤、C4d 沉积、血栓性微血管病(TMA)临床与组织病理学表现、高血压性视网膜病变及补体基因研究等内容。数据可用于硬皮病肾危象与补体激活、内皮损伤相关性的学习与讨论,但样本量有限,源站未提供更多结构化字段(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Endothelial lesion and complement activation in patients with Scleroderma Renal Crisis》发表于 Brazilian Journal of Nephrology(2019),DOI:10.1590/2175-8239-jbn-2018-0202。源站首次发布:2019-02-27。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):摘要 在肾脏活检综述中,硬皮病肾危象(SRC)的特征是血管内皮损伤、肾小管周围血管上的 C4d 沉积,以及同一活检标本上急性和慢性损伤并存。血栓性微血管病(TMA)的临床征象在系统性硬化症(SSc)中已有描述,然而,尚未将其与肾脏活检所描述的急性损伤相关联。我们报告一例硬皮病-皮肌炎重叠综合征患者的 SRC 病例,该患者同时表现出 TMA 的临床和组织病理学数据。眼底检查发现严重的急性高血压性视网膜病变。肾脏活检显示严重的内皮损伤,内膜水平黏液样细胞增宽,大多数小动脉上局灶性同心性增生,以及沿毛细血管壁的 C3、C4d 和 IgM 沉积。补体的基因研究仅显示前

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 2.36 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.7773695.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Nephrology and Urology。主题标签:Scleroderma, Localized、Thrombotic Microangiopathy、Systemic Sclerosis、Hypertensive Retinopathy、Endothelium、Complement Activation。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Nephrology and Urology。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Endothelial_lesion_and_complement_activation_in_patients_with_Scleroderma_Renal_Crisis/7773695

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Pérez, Ney Arencibia; Morales, María Luisa Agüera; Sánchez, Rafael Sánchez; Salas, Rosa María Ortega; Puebla, Rafael Ángel Fernández de la; Hernández, Mario Espinosa (2019). Endothelial lesion and complement activation in patients with Scleroderma Renal Crisis. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "2175-8239-jbn-2018-0202-gf01.jpg" "https://ndownloader.figshare.com/files/14474441"
curl -L -o "2175-8239-jbn-2018-0202-gf02.jpg" "https://ndownloader.figshare.com/files/14474447"

文件清单

  • 2175-8239-jbn-2018-0202-gf01.jpg(759.02 KB)
  • 2175-8239-jbn-2018-0202-gf02.jpg(1.60 MB)

文件总体积 2.36 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

摘要 在肾活检综述中,硬皮病肾危象(SRC)的特征是血管内皮损伤、肾小管周围血管C4d沉积,以及同一活检标本中急性和慢性损伤并存。血栓性微血管病(TMA)的临床征象在系统性硬化症(SSc)中已有描述,然而,其尚未与肾活检所描述的急性损伤相关联。我们报告一例硬皮病-皮肌炎重叠综合征患者的SRC病例,该患者同时表现出TMA的临床和组织病理学资料。眼底检查发现严重的急性高血压性视网膜病变。肾活检显示严重的内皮损伤,内膜水平黏液样细胞增宽,大多数小动脉上局灶性同心性增生,以及沿毛细血管壁的C3、C4d和IgM沉积。补体基因研究仅显示存在膜辅因子蛋白(MCP)风险单倍型,无其他遗传性补体疾病。我们认为,在TMA合并SSc的患者中,肾脏损伤基本上为内皮性且属急性类型;此外,我们会观察到补体激活的明确证据。

一旦进一步的研究将临床-分析数据与解剖病理学研究相关联,我们很可能将不得不重新定义SRC的概念,重点关注急性内皮损伤与补体激活之间的关系。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.7773695.v1(source: https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Endothelial_lesion_and_complement_activation_in_patients_with_Scleroderma_Renal_Crisis/7773695)。

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