ST005197:PAX2和PAX8缺失对肾皮质基线中心碳代谢物谱的影响

研究主题为PAX2和PAX8缺失对肾皮质基线中心碳代谢物谱的影响,属于泌尿生殖系统疾病/其他分类。数据可用于分析PAX2和PAX8缺失条件下肾皮质中心碳代谢物的基线变化,支持代谢通路相关研究(来源 metabolomicsworkbench.org)

University of MichiganUniversity of Michigan
metabolomics_workbench
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基因组LC-MS
ST005197: Effect of PAX2 and PAX8 depletion on the baseline central carbon metabolite profile of the kidney cortex

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

ST005197:PAX2和PAX8缺失对肾皮质基线中心碳代谢物谱的影响

ST005197 是一个以 LC-MS 为技术平台的代谢组学研究数据集,英文全称为“Effect of PAX2 and PAX8 depletion on the baseline central carbon metabolite profile of the kidney cortex”。该数据集聚焦于 PAX2 与 PAX8 缺失条件下小鼠肾皮质基线中心碳代谢物谱的变化,归属于泌尿生殖系统疾病 / 其他分类,数据来源于 metabolomicsworkbench.org。整体而言,该数据集可用于观察上述两个基因缺失对肾皮质中心碳代谢物基线水平的影响,并为相关代谢通路研究提供数据支持。

【数据集背景】

PAX2 和 PAX8 是肾脏发育与泌尿生殖系统研究中受到关注的转录因子。该数据集围绕这两个因子缺失后肾皮质中心碳代谢物谱的基线状态展开,属于泌尿生殖系统疾病 / 其他分类下的代谢组学研究。其研究问题在于比较 PAX2、PAX8 缺失条件下肾皮质中心碳代谢物的基线变化,从而为理解相关代谢过程提供线索。源站将该研究描述为一项 LC-MS 代谢组学研究,实验物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Michigan。

【数据内容】

数据集的核心内容是肾皮质在 PAX2 和 PAX8 缺失条件下的基线中心碳代谢物谱。中心碳代谢涉及糖酵解、三羧酸循环等核心代谢环节,因此该数据可用于分析缺失条件下这些代谢物基线水平的变化。数据集以 LC-MS 为技术标签,表明其代谢物检测基于液相色谱-质谱联用。除上述主题与分类信息外,源站未提供代谢物数量、样本数量、分组规模等具体内容。

【采集与来源】

该数据集来自 metabolomicsworkbench.org。源站描述显示,研究采用 LC-MS 方法,物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Michigan。数据集编号为 ST005197。关于样本采集部位、动物品系、饲养条件、样本处理流程、色谱与质谱参数等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于分析 PAX2 和 PAX8 缺失条件下肾皮质中心碳代谢物的基线变化,支持代谢通路相关研究。具体可用于比较缺失组与基线状态之间中心碳代谢物谱的差异,为泌尿生殖系统疾病 / 其他分类下的代谢机制探索提供数据基础,也可作为 LC-MS 代谢组学方法在肾脏组织研究中的应用参考。关于更具体的疾病模型或临床转化场景,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可围绕 PAX2、PAX8 缺失与肾皮质中心碳代谢物基线谱之间的关系开展分析,例如对 LC-MS 检测得到的代谢物谱进行组间比较和通路层面的解读。由于源站未提供样本分组、代谢物列表、定量矩阵及统计方法等信息,具体分析流程需依据源站数据页面进一步确认。源站未提供标准化的使用指南或分析脚本。

【质量与限制】

该数据集为 LC-MS 代谢组学研究,物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Michigan,来源为 metabolomicsworkbench.org。其限制在于:源站未提供样本量、代谢物鉴定置信度、定量精度、缺失值比例、批次效应及验证实验等信息,因此无法在本介绍中评估数据质量。使用时应结合源站原始记录核实数据完整性与适用范围。此外,该数据集聚焦肾皮质中心碳代谢物基线谱,结论不宜直接外推至其他组织或其他代谢物类别。

【引用与许可】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,编号为 ST005197。关于引用格式、许可条款、数据使用协议及联系方式,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅源站对应页面获取授权与引用要求。

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数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST005197

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (LC-MS). Species: Mus musculus. Institute: University of Michigan.

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