增殖期子宫内膜单细胞测序数据集

该数据集来自ebi.ac.uk,为健康育龄女性增殖期子宫内膜的单细胞测序数据。研究人员在月经周期第7天采集24至42岁健康育龄女性的子宫内膜活检样本,制备单细胞悬液后于10x平台进行单细胞测序

biostudies
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基因组分类RNA-seq of coding RNA from single cellsHuman - Single-cell sequencingHomo sapiens
Single cell sequencing of the proliferative endometrium

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

增殖期子宫内膜单细胞测序数据集

该数据集为健康育龄女性增殖期子宫内膜的单细胞测序数据,来源于ebi.ac.uk。研究人员在月经周期第7天采集24至42岁健康育龄女性的子宫内膜活检样本,制备单细胞悬液后于10x平台进行单细胞测序。数据集英文名为Single cell sequencing of the proliferative endometrium,主题标签涵盖单细胞编码RNA的RNA-seq、人类单细胞测序及Homo sapiens,本站分类归入泌尿生殖系统疾病/其他。该数据为研究增殖期子宫内膜的细胞组成与转录特征提供了单细胞层面的原始测序资源。

【数据集背景】

子宫内膜是随月经周期发生周期性重塑的组织,增殖期是其修复与增生的关键阶段。该数据集聚焦健康育龄女性增殖期子宫内膜,采用单细胞测序技术解析其细胞层面的转录信息。样本采集时间统一设定为月经周期第7天,受试者为24至42岁的健康育龄女性,这一设计有助于在相对一致的生理窗口内观察子宫内膜的细胞构成。数据集来源站为ebi.ac.uk,主题标签包括RNA-seq of coding RNA from single cells、Human - Single-cell sequencing与Homo sapiens,表明其属于人类单细胞转录组测序范畴。

【数据内容】

该数据集的核心内容为单细胞水平的基因表达测序数据,技术路线为单细胞RNA测序,检测对象为编码RNA。样本经处理后制备为单细胞悬液,并在10x平台上完成单细胞测序。主题标签中的“RNA-seq of coding RNA from single cells”说明了数据的基本类型,“Human - Single-cell sequencing”与“Homo sapiens”则明确了物种来源为人类。关于数据的具体样本数量、细胞数、测序深度、文件格式与数据规模,源站未提供。

【采集与来源】

样本为子宫内膜活检组织,采集对象为24至42岁的健康育龄女性,采集时间为月经周期第7天。活检样本经处理制备成单细胞悬液后,提交至10x平台进行单细胞测序。数据来源站为ebi.ac.uk。除上述采集时间、年龄范围、健康状态与测序平台信息外,关于采集地点、伦理审批、样本编号体系等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究增殖期子宫内膜在单细胞层面的细胞类型组成与基因表达特征,适用于人类生殖生物学、子宫内膜周期性变化及相关泌尿生殖系统疾病背景研究中的参考或对比分析。由于受试者限定为健康育龄女性且采样时间统一为月经周期第7天,该数据也适合作为增殖期子宫内膜单细胞表达的基线资料。关于该数据集在具体疾病研究中的直接应用结论,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据其单细胞RNA测序数据的性质,开展细胞聚类、细胞类型注释、基因表达比较等常规单细胞转录组分析。由于数据来自10x平台,分析流程需适配该平台产生的单细胞表达数据格式。关于数据的具体下载方式、文件组织、配套元数据字段与分析建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的受试者年龄范围为24至42岁,采样时间固定为月经周期第7天,样本来自健康育龄女性,这些条件构成了数据解释时的基本边界。关于测序质量指标、细胞存活率、批次信息、样本重复数及潜在技术偏差,源站未提供。使用时应结合上述采集条件谨慎外推结论。

【引用与许可】

该数据集来源于ebi.ac.uk。关于数据集的引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-10947

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-MTAB-10947 增殖期子宫内膜的单细胞测序,来自单细胞的编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0005684 人类 - 单细胞测序 智人 子宫内膜活检样本采集自年龄24-42岁的健康有生育能力女性月经周期第7天。活检样本经过处理

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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