沙漠啮齿动物严重急性脱水引发有效预防肾损伤的转录响应

该数据集来自 search.dataone.org,围绕沙漠适应啮齿动物 Peromyscus eremicus 在 72 小时禁水后平均失去 23% 体重的严重急性脱水模型,提供肾脏 RNAseq 转录组数据

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基因组分类RNAseqPeromyscus eremicusKidneyDesertdehydration
Severe acute dehydration in a desert rodent elicits a transcriptional response that effectively prevents kidney injury

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

沙漠啮齿动物严重急性脱水引发有效预防肾损伤的转录响应

Severe acute dehydration in a desert rodent elicits a transcriptional response that effectively prevents kidney injury

该数据集来自 search.dataone.org,围绕沙漠适应啮齿动物 Peromyscus eremicus 在 72 小时禁水后平均失去 23% 体重的严重急性脱水模型,提供肾脏 RNAseq 转录组数据。数据可用于研究脱水应激下基因表达调控、水盐平衡维持、细胞外基质周转与凋亡抑制等肾脏保护机制,并支持与人类肾损伤经典响应进行对比分析(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):生活在沙漠环境中的动物被迫在酷热、强烈太阳辐射以及急性和慢性脱水条件下生存。这些动物已演化出有效应对这些环境胁迫的表型。为了初步了解沙漠适应啮齿动物 P. eremicus 的生存方式,我们进行了一项实验,使生殖成熟的成年个体经历 72 小时禁水,在此期间它们平均失去 23% 的体重。这些动物通过肾脏的一系列变化作出反应,包括调节负责降低转录速率以及维持水和盐平衡的基因表达。细胞外基质周转似乎减少,凋亡受到限制。血清肌酐和其他肾损伤生物标志物未升高,这与经典人类反应不同。

【主题与分类】

主题标签:RNAseq、Peromyscus eremicus、Kidney、Desert、dehydration。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Abb2b9b25ae9b53961dcd89359bbc2b864a701482563f4b3b5a5b299f7dd8d295

使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

生活在沙漠环境中的动物被迫在酷热、强烈的太阳辐射以及急性和慢性脱水的条件下生存。这些动物已经进化出能够有效应对这些环境胁迫的表型。为了初步了解适应沙漠环境的啮齿动物P. eremicus的生存方式,我们进行了一项实验,将生殖成熟的成年个体置于72小时的禁水条件下,在此期间它们平均失去了23%的体重。这些动物通过肾脏的一系列变化做出反应,包括调节负责降低转录速率以及维持水和盐平衡的基因表达。细胞外基质周转似乎减少,细胞凋亡受到限制。血清肌酐和其他肾损伤生物标志物未升高,这与经典的人类反应不同,表明与急性脱水相关的基因表达变化可能有效阻止了仙人掌鼠发生广泛的肾脏损伤。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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