肾结石患者尿液与结石基质蛋白质组分析
主题标签:肾结石、尿液蛋白质组、结石基质、泌尿生殖系统疾病。本站分类:泌尿生殖系统疾病。本数据集为泌尿生殖系统疾病领域公开数据集,主题涵盖肾结石。

基本信息
资源简介
肾结石患者尿液与结石基质蛋白质组分析
Proteomic analysis of urine and stone matrix of patients with kidney calculi 是一个聚焦肾结石相关蛋白质组学的公开数据集,主题涵盖肾结石、尿液蛋白质组与结石基质,归属于泌尿生殖系统疾病领域。该数据集由 Andreas Schlosser 于 2016 年发布,收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD000302。数据集围绕肾结石患者的尿液与结石基质两类样本展开蛋白质组学分析,为研究肾结石形成机制及相关生物标志物提供数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
肾结石是泌尿生殖系统疾病中的常见类型,其形成涉及尿液成分、结晶过程与基质蛋白等多方面因素。对患者尿液和结石基质进行蛋白质组学分析,有助于从蛋白质层面理解结石形成的生物学过程。该数据集正是在这一研究背景下产生,主题标签明确指向肾结石、尿液蛋白质组与结石基质,属于泌尿生殖系统疾病领域的公开数据资源。
【数据内容】
该数据集的名称为 Proteomic analysis of urine and stone matrix of patients with kidney calculi,从名称可知其内容涉及对肾结石患者的尿液和结石基质进行蛋白质组分析。数据集的主题涵盖肾结石、尿液蛋白质组与结石基质。关于样本数量、蛋白质鉴定数量、仪器型号、实验分组等具体内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体为 PRIDE 归档平台的项目 PXD000302,由 Andreas Schlosser 于 2016 年发布。数据集的来源站描述为:Andreas Schlosser (2016). Proteomic analysis of urine and stone matrix of patients with kidney calculi [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000302。关于样本采集地点、患者招募标准、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于泌尿生殖系统疾病领域的研究,尤其是肾结石相关的蛋白质组学分析。潜在应用包括:探索肾结石患者尿液中的蛋白质组成特征、比较尿液与结石基质中的蛋白质分布、寻找与结石形成相关的候选蛋白标志物,以及作为蛋白质组学方法学研究的参考数据。关于具体应用案例或已验证的分析结论,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为公开数据集,可通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台项目页面 PXD000302 访问。关于数据文件格式、下载方式、检索接口、分析流程或配套工具等具体使用说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开的蛋白质组学归档数据,其质量与限制的具体信息,如数据完整性评估、鉴定置信度标准、样本量大小、覆盖度等,源站未提供。使用时应注意其主题范围限定于肾结石患者的尿液与结石基质蛋白质组分析。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参考来源站描述中的引用格式:Andreas Schlosser (2016). Proteomic analysis of urine and stone matrix of patients with kidney calculi [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000302。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000302
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Andreas Schlosser (2016). Proteomic analysis of urine and stone matrix of patients with kidney calculi [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000302
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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