PRJNA1532993：Huh7.5.1与Vero E6细胞中埃博拉病毒RNA二级结构的icSHAPE图谱
数据围绕埃博拉病毒RNA在两种宿主细胞系中的二级结构展开，采用icSHAPE技术进行profiling。BioProject记录汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型，便于用户集中查找该计划产生的各类数据
基本信息
资源简介
PRJNA1532993：Huh7.5.1与Vero E6细胞中埃博拉病毒RNA二级结构的icSHAPE图谱
PRJNA1532993 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的研究计划记录，其英文标题为“icSHAPE profiling of Ebola virus RNA secondary structures in Huh7.5.1 and Vero E6 cells”。该计划聚焦于埃博拉病毒 RNA 二级结构，采用 icSHAPE 技术，在 Huh7.5.1 与 Vero E6 两种宿主细胞系中开展 profiling 研究。BioProject 作为生物数据的集合，旨在将源自单一研究计划或联盟的多种数据类型汇聚于一处，使用户能够通过一条记录集中定位该计划所产生的各类数据。本站将该数据集归入“泌尿生殖系统疾病 / 其他”分类，主题标签为“Other”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
埃博拉病毒是一种具有包膜的单股负链 RNA 病毒，其 RNA 二级结构在病毒复制、转录及与宿主因子互作中可能发挥重要调控作用。icSHAPE 是一种能够在全转录组水平探测 RNA 二级结构的技术，通过化学修饰结合高通量测序，可在活细胞环境下获取 RNA 单链与双链区域的分布信息。该 BioProject 记录围绕埃博拉病毒 RNA 在两种不同宿主细胞系中的二级结构展开，旨在为理解病毒 RNA 结构在特定宿主环境下的组织形式提供数据基础。BioProject 本身是生物数据的集合，来源于单一研究计划或联盟，为用户提供查找该计划所产生多种数据类型的统一入口。
【数据内容】
该数据集的核心内容为埃博拉病毒 RNA 二级结构的 icSHAPE profiling 数据，涉及 Huh7.5.1 和 Vero E6 两种细胞系。BioProject 记录汇集了与这一单一研究计划相关的多种数据类型，便于用户集中查找该计划产生的各类数据。关于具体的数据文件格式、样本数量、测序深度、结构探测位点数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，记录标识为 PRJNA1532993。研究涉及在 Huh7.5.1 与 Vero E6 细胞系中进行 icSHAPE profiling。BioProject 作为单一研究计划的入口，整合了该计划产生的多种数据类型。关于样本制备、化学处理、测序平台、数据生成时间等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于对埃博拉病毒 RNA 二级结构感兴趣的研究场景，尤其是在不同宿主细胞背景下比较病毒 RNA 结构特征的研究。icSHAPE 数据可用于分析 RNA 单链与双链区域的分布，辅助理解病毒 RNA 结构与宿主环境之间的关系。此外，由于 BioProject 汇集了单一计划的多种数据类型，该记录也可作为查找该研究计划相关数据的入口。关于该数据集是否适用于特定分析流程或与其他数据集联合使用，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该记录，标识为 PRJNA1532993。BioProject 记录提供指向该计划所产生多种数据类型的链接，用户可据此定位并获取相关数据。关于具体的数据下载方式、文件组织格式、分析工具推荐或处理流程，源站未提供。
【质量与限制】
该记录来自 NCBI BioProject 数据库，属于生物数据集合的入口记录。关于数据质量评估指标、测序质量、覆盖度、重复性、技术偏差等具体信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及 Huh7.5.1 与 Vero E6 两种细胞系，关于其结论能否推广至其他细胞类型或体内环境，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或相关发表物信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1532993
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们开展了全基因组icSHAPE分析，以确定埃博拉病毒RNA在Huh7.5.1人肝细胞衍生细胞和Vero E6猴肾细胞的细胞内和细胞外环境中的二级结构，从而描绘出病毒基因组的结构图谱。通过将RNA结构数据与共变异分析相结合，鉴定出具有潜在调控功能的进化保守RNA结构元件。利用SMRTnet筛选靶向这些结构的候选小分子，并利用MuSIC预测相互作用的RNA结合蛋白。这种整合策略有助于揭示功能性RNA元件及其调控网络，为开发针对埃博拉病毒感染的RNA靶向治疗策略提供了基础。原始测序数据也已归档于中国国家生物信息中心的Genome Sequence Archive，BioProject编号为PRJCA074507（Huh7.5.1数据集：HRA021191）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
