基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1529671：MT-ND3相关OXPHOS优势单核细胞状态限制免疫功能低下患者的疫苗反应

该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目，项目编号为 1529671，英文名称为“A pre-existing MT-ND3-linked OXPHOS-dominant monocyte state constrains vaccine responsiveness in immunocompromised patients”。从名称可以看出，该项目的核心研究主题是免疫功能低下患者体内预先存在的一种与 MT-ND3 相关的、以氧化磷酸化（OXPHOS）占优势的单核细胞状态，以及这种状态对疫苗反应性所产生的限制作用。BioProject 作为生物数据的集合记录，通常围绕某一项单一研究计划或倡议而建立，来源于一个组织或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集在分类上归属于泌尿生殖系统疾病 / 其他，主题标签为 Other，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1529671。BioProject 是围绕单一研究倡议而组织起来的生物数据集合，这些倡议通常来自一个组织或一个联合体。BioProject 记录的作用在于为用户提供一个统一的位置，以便找到针对该项目所生成的各种数据类型。就本项目而言，其标题指向免疫功能低下患者中疫苗反应性受限的问题，并聚焦于一种预先存在的、与 MT-ND3 相关的 OXPHOS 优势单核细胞状态。该主题涉及免疫缺陷背景下疫苗应答的细胞与代谢机制，属于生物医学研究范畴。本站将其归类为泌尿生殖系统疾病 / 其他，主题标签为 Other。

【数据内容】

源站未提供该项目所包含的具体数据类型、样本数量、测序平台、组学层次或文件格式等细节。BioProject 记录本身提供的是指向该项目相关数据的链接入口，而非对数据内容的逐项列举。因此，关于该数据集内部具体包含哪些数据文件、覆盖多少样本、采用何种实验设计等信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目编号为 1529671。BioProject 记录来源于单一组织或联合体所发起的研究倡议。关于样本采集地点、采集时间、受试者人群特征、伦理审批信息以及具体的研究机构等，源站未提供。

【适用场景】

基于项目标题所反映的主题，该数据集可能适用于与免疫功能低下患者疫苗反应性、单核细胞状态、MT-ND3 相关机制以及 OXPHOS 优势代谢特征等方向相关的研究场景。同时，作为 BioProject 记录，它可用于查找该项目所生成的多种数据类型。由于源站未提供具体数据内容，无法进一步说明其适用的具体分析类型或研究设计。本站分类为泌尿生殖系统疾病 / 其他，主题标签为 Other，这一分类信息可作为检索与归类时的参考。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、访问协议、下载方式或分析流程。作为 BioProject 记录，其一般用途是提供指向该项目相关数据的链接入口，用户可通过该记录查找该项目所生成的不同数据类型。关于如何具体使用该项目的数据，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息、数据完整性说明、质控指标或已知限制。由于缺乏具体数据内容、样本信息与实验细节，无法对该数据集的质量与适用范围做出进一步判断。使用时应以源站记录及其链接的实际数据为准。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可条款或使用限制。如需引用或使用，应参考 NCBI BioProject 记录页面及其关联数据所附带的说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347367

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1529671

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肾移植受者常对mRNA疫苗接种表现出受损的免疫应答。本研究采用外周血单个核细胞的纵向单细胞转录组和蛋白质谱分析，以识别与后续疫苗应答相关的接种前免疫状态。数据集包括一个mRNA-1273发现队列、纵向加强针相关样本，以及一个独立的BNT162b2肾移植队列。多名参与者的样本通过hashtag寡核苷酸进行多重标记，随后进行计算HTO去多重化。患者特异性处理后的Seurat对象保留了细胞水平的RNA计数以及可用的抗体衍生标签和hashtag检测数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别