马α疱疹病毒1型（EHV-1）动态直接cDNA转录组测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB76233

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

马疱疹病毒1型以0.1 MOI（感染复数）在兔肾细胞系（RK-13/35）上扩增。样品在感染后不同时间点分离，具体如下：1小时、2小时、4小时、6小时、8小时、12小时、24小时、48小时。使用Macherey Nagel RNA Nucleospin试剂盒分离Poly(A)选择的RNA，并用SQK-DCS109试剂盒制备dcDNA文库。病毒和宿主细胞转录组在Oxford Nanopore MinION设备上测序。POD5文件使用Dorado碱基识别器处理为fastq文件。上传的gzip压缩文件为包含病毒和宿主reads的.fastq文件。该研究旨在检测感染过程中的新病毒异构体。该数据集为EHV-1转录组的基因表达动力学变化以及宿主-病毒转录组变化提供了新见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。