PRJEB104179：Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子（小鼠肾小球 CUT&TAG）
数据围绕 Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子这一研究方向，采用 CUT&TAG 技术对小鼠肾小球进行检测
基本信息
资源简介
PRJEB104179：Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子（小鼠肾小球 CUT&TAG）
该数据集围绕 Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子这一研究方向展开，采用 CUT&TAG 技术对小鼠肾小球进行检测，属于泌尿生殖系统疾病领域的其他类数据。数据来源于 NCBI BioProject 数据库，项目英文名称为 PRJEB104179: Wt1os lncRNA as a Novel Regulator of Podocyte Function (CUT&TAG of mouse glomeruli)。BioProject 是围绕某一特定研究计划汇集而成的生物数据集合，通常来自单一机构或联合体，其记录为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集的主题标签为 Other，整体定位偏向基础研究层面，关注 lncRNA 在足细胞功能调控中的潜在作用。
【数据集背景】
足细胞是肾小球滤过屏障的重要组成部分，其功能异常与多种泌尿生殖系统疾病密切相关。Wt1os 是一种长链非编码 RNA（lncRNA），该数据集所对应的研究将其视为足细胞功能的新型调控因子，试图从表观遗传或染色质结合层面探索其调控机制。CUT&TAG 是一种用于检测染色质蛋白结合位点或组蛋白修饰的技术，具有较低起始量需求和较高信噪比的特点。该研究选择小鼠肾小球作为实验材料，说明其关注的是肾小球中足细胞相关调控事件。源站未提供该研究的具体假设、实验分组或预期结论。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对小鼠肾小球开展的 CUT&TAG 检测数据。CUT&TAG 技术通常产生与染色质结合位点相关的测序读段，可用于定位特定蛋白或修饰在基因组上的富集区域。由于该数据集的主题标签为 Other，且源站未提供更细化的数据类型说明，因此除 CUT&TAG 检测本身外，无法确认是否包含其他组学层面或验证性数据。源站未提供样本数量、测序深度、目标蛋白或修饰类型等具体信息。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，项目编号为 PRJEB104179，源站标题为“Wt1os lncRNA as a Novel Regulator of Podocyte Func... (ID 1485225) - BioProject - NCBI”。BioProject 作为生物数据集合的登记入口，汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型。该项目的来源机构或联合体信息、实验实施地点、时间范围等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 lncRNA 在足细胞功能调控中作用的相关工作，尤其是关注 Wt1os 的染色质结合特征或表观调控机制的场景。CUT&TAG 数据可用于分析小鼠肾小球中特定靶点的基因组分布，进而与转录组、表观基因组或其他功能实验数据联合解读。此外，该数据集也可作为泌尿生殖系统疾病领域基础研究的数据资源，供方法学比较或数据整合分析使用。源站未提供该数据集在临床诊断、药物开发或转化医学中的具体应用说明。
【使用方法】
使用该数据集时，通常需要从 NCBI BioProject 记录出发，查找其关联的原始测序数据或分析结果。CUT&TAG 数据的分析流程一般包括读段质控、比对至小鼠参考基因组、峰 calling 以及富集区域注释等步骤。由于源站未提供该项目的具体数据格式、文件组织方式或推荐分析工具，使用者应根据实际下载到的数据内容自行确定处理方案。源站未提供该数据集的使用教程或标准操作流程。
【质量与限制】
该数据集的质量控制信息、数据完整性评估、批次效应说明等，源站未提供。由于源站描述仅对 BioProject 作一般性说明，未涉及该项目的具体实验设计、重复数、对照设置或技术验证，因此无法对数据质量作出具体判断。该数据集仅针对小鼠肾小球，物种和组织的局限性意味着其结论不能直接外推至人类或其他组织。此外，CUT&TAG 技术本身可能受到抗体特异性、背景信号等因素影响，但源站未提供该项目的相关质控指标。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或数据共享政策，源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 记录页面及关联数据条目中可能列出的引用要求与许可条款。源站未提供该项目的具体文献出处或致谢信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB104179
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探究足细胞特异性长链非编码RNA Wt1os（人类直系同源物WT1-AS）的生物学作用及其对肾小球健康与疾病的贡献。实验流程整合了体内和细胞培养方法。我们构建了Wt1os功能缺失小鼠模型，并利用组织学技术和高分辨率显微镜评估了肾脏形态与功能。通过H3K27ac组蛋白修饰的CUT&Tag分析评估了启动子活性。该数据集包含来自3只野生型小鼠和3只Wt1os功能缺失突变小鼠的CUT&TAG数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
