Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子(小鼠肾小球 RNA-Seq)

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目,研究 Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子的作用,样本为小鼠肾小球

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PRJEB104046: Wt1os lncRNA as a Novel Regulator of Podocyte Function (RNA-Seq of mouse glomeruli)

基本信息

模态
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创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子(小鼠肾小球 RNA-Seq)

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目,英文名称为 PRJEB104046: Wt1os lncRNA as a Novel Regulator of Podocyte Function (RNA-Seq of mouse glomeruli)。项目围绕 Wt1os 长链非编码 RNA(lncRNA)作为足细胞功能新型调控因子这一研究方向展开,所采用的样本为小鼠肾小球,检测手段为 RNA-Seq。在 BioProject 体系中,每一条记录用于汇集由单一机构或联合体发起的同一项研究计划所产生的多种类型生物学数据,并为用户提供统一入口以获取与该计划相关的数据链接。本站将该数据集归类于泌尿生殖系统疾病 / 其他,主题标签为 Other,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

足细胞是肾小球滤过屏障的重要组成部分,其功能异常与多种泌尿生殖系统疾病相关。该 BioProject 所对应的研究计划聚焦于 Wt1os lncRNA,将其视为足细胞功能的一种新型调控因子,并选择小鼠肾小球作为研究材料,通过 RNA-Seq 手段获取转录组层面的数据。项目标题直接体现了研究目标与实验体系,即围绕 Wt1os lncRNA 在足细胞功能调控中的作用,利用小鼠肾小球的 RNA-Seq 数据开展分析。该记录来源于 NCBI BioProject,属于面向单一研究计划的生物学数据集合。

【数据内容】

该数据集的核心内容为 RNA-Seq 数据,样本来源为小鼠肾小球。项目标题表明其研究主题为 Wt1os lncRNA 作为足细胞功能新型调控因子的作用。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、读长、数据量、比对结果、表达矩阵或差异分析结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库,记录标识为 ID 1485213。BioProject 记录本身用于汇集由单一机构或联合体发起的同一项研究计划所产生的多种数据类型,并提供统一入口以链接相关数据。关于本项目的具体提交机构、合作方、样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及实验操作流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于项目标题与样本类型,该数据集可用于围绕 Wt1os lncRNA 与足细胞功能关系的研究,例如在小鼠肾小球转录组层面考察 Wt1os lncRNA 的表达特征及其与足细胞功能相关基因的关联。同时,该数据也可作为泌尿生殖系统疾病相关研究中肾小球转录组数据的参考来源之一。由于本站将其归类为泌尿生殖系统疾病 / 其他,主题标签为 Other,因此其适用场景也可涵盖更广泛的肾小球生物学与 lncRNA 功能研究。具体分析用途需结合源站提供的原始数据与元数据确定,源站未提供针对特定分析流程的说明。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目,使用者可通过 BioProject 记录获取与该计划相关的数据链接,进而访问由该计划产生的多种数据类型。BioProject 记录的作用在于提供单一入口以定位相关数据。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具或代码等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库收录的项目记录。其质量与限制取决于原始提交数据及项目本身的实验设计,源站未提供关于数据质量评估、批次效应、样本量、重复数、测序深度或潜在偏倚的具体信息。此外,该记录为 BioProject 层面的集合描述,可能不包含完整的分析结果或结论。使用者在解释数据时需注意项目标题所限定的研究范围,即 Wt1os lncRNA 与足细胞功能及小鼠肾小球 RNA-Seq 这一特定语境。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标识为 ID 1485213。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据提交方所附的具体说明。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB104046

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是探究足细胞特异性长链非编码RNA Wt1os(人类直系同源物WT1-AS)的生物学作用及其对肾小球健康和疾病的贡献。我们构建了Wt1os功能缺失小鼠模型,并利用组织学技术和高分辨率显微镜评估了肾脏形态和功能。通过总RNA测序分析了肾小球转录组。该数据集包含来自3只野生型和3只Wt1os功能缺失突变小鼠的总RNA-Seq数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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