ADTKD-Umod 空间转录组数据(PRJDB44128)
该数据集为 Umod p.His36Tyr 突变小鼠肾脏的空间转录组数据,来源于 NCBI,本站归类为泌尿生殖系统疾病 / 其他

基本信息
资源简介
ADTKD-Umod 空间转录组数据(PRJDB44128)
PRJDB44128(PRJCA052807)是一项聚焦遗传性肾脏疾病模型的空间转录组数据集,其全称为“The spatial transcriptomic data of ADTKD-Umod”。该数据集收录的是携带 Umod p.His36Tyr 突变的小鼠肾脏空间转录组数据,从分子层面记录突变肾脏组织在空间维度上的基因表达信息。数据集来源于 NCBI,在本地分类体系中归入泌尿生殖系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Other。整体而言,它为研究 Umod 突变相关肾脏病变提供了一个以空间分辨方式观察肾脏转录活动的数据资源,可供从事肾脏疾病机制探索、遗传性肾病模型分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集围绕 ADTKD-Umod 展开。ADTKD 指常染色体显性肾小管间质性肾病,Umod 是其相关基因之一,本数据集对应的是 Umod p.His36Tyr 突变小鼠模型。源站描述明确指出,这批数据为“Umod p.His36Tyr mutant mouse kidney spatial transcriptome data”,即突变小鼠肾脏的空间转录组数据。借助空间转录组技术,研究者可以在保留组织空间位置信息的前提下考察肾脏内不同区域的基因表达状况,从而为理解 Umod 突变如何在肾脏组织中产生分子层面的影响提供数据基础。关于该突变的具体致病机制、模型构建细节及研究背景,源站未提供。
【数据内容】
数据集的内容为小鼠肾脏的空间转录组数据,样本对象是携带 Umod p.His36Tyr 突变的小鼠肾脏组织。空间转录组数据的核心特征在于将转录本表达信息与组织切片上的空间位置相对应,因此该数据集所承载的是突变肾脏组织在空间维度上的基因表达谱信息。除上述内容外,数据的具体样本数量、测序平台、基因数目、空间分辨率、数据文件格式与规模等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),编号为 PRJDB44128,同时标注有 PRJCA052807。其源站描述为“Umod p.His36Tyr mutant mouse kidney spatial transcriptome data”。关于样本采集的具体流程、实验操作步骤、测序策略及数据处理管线等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容特征,该数据集可适用于以下方向:一是研究 Umod p.His36Tyr 突变小鼠肾脏在空间层面上的基因表达分布特征;二是作为遗传性肾小管间质性肾病模型的空间转录组参考数据,用于与其他肾脏组织转录组数据进行比较分析;三是为肾脏疾病相关的空间生物学研究提供数据支撑。需要说明的是,上述适用方向系依据数据主题与类型所作的通用性说明,源站未提供关于具体应用案例或验证结论的信息。
【使用方法】
该数据集通过 NCBI 来源站点获取,编号为 PRJDB44128(PRJCA052807)。关于数据下载方式、文件组织方式、分析流程、配套工具及使用注意事项等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为小鼠模型来源的空间转录组数据,其物种与疾病模型具有特定性,结论外推到人类或其他模型时需谨慎。关于数据质量评估指标、质控结果、批次信息及已知技术限制等,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处及许可使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅来源站点的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB44128
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Umod p.His36Tyr mutant mouse kidney spatial transcriptome data
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