ADTKD-Umod小鼠肾脏单细胞RNA转录组测序数据集

该数据集为携带His36Tyr突变的ADTKD-Umod小鼠肾脏单细胞RNA转录组测序数据,来源于ncbi.nlm.nih.gov,本站归类为泌尿生殖系统疾病/其他

sra
浏览 8
基因组分类Other
PRJDB44124: ADTKD-Umod (PRJCA052788)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

ADTKD-Umod小鼠肾脏单细胞RNA转录组测序数据集

PRJDB44124: ADTKD-Umod(PRJCA052788)是一个面向泌尿生殖系统疾病研究领域的单细胞转录组数据集,聚焦于携带His36Tyr突变的ADTKD-Umod小鼠肾脏。该数据集的核心内容是对上述突变模型小鼠肾脏组织开展的单细胞RNA转录组测序,旨在从单细胞分辨率呈现肾脏内不同细胞群体的基因表达特征。数据集来源于ncbi.nlm.nih.gov,在本站归类为泌尿生殖系统疾病/其他,主题标签为Other。整体而言,该数据集为研究ADTKD-Umod相关肾脏病变的细胞异质性与转录组改变提供了原始测序层面的数据基础,适合从事遗传性肾病、肾脏细胞生物学及单细胞测序分析的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集对应的生物学背景为ADTKD-Umod(常染色体显性肾小管间质性肾病,Umod相关)小鼠模型,其携带His36Tyr突变。源站描述明确指出,该数据集是对携带该突变的小鼠肾脏进行单细胞RNA转录组测序所获得的数据。ADTKD-Umod属于泌尿生殖系统疾病范畴,本站将其归入“泌尿生殖系统疾病/其他”分类,主题标签为Other。数据集英文名中同时出现PRJDB44124与PRJCA052788两个编号标识,可作为检索与引用时的识别依据。

【数据内容】

数据集的内容为单细胞RNA转录组测序数据,测序对象为携带His36Tyr突变的ADTKD-Umod小鼠的肾脏。单细胞RNA转录组测序的一般用途是在单个细胞层面测定基因表达水平,从而刻画组织内细胞类型的构成与状态;就该数据集而言,其数据即围绕上述突变小鼠肾脏的单细胞转录组展开。除源站描述所提及的测序对象与测序类型外,数据的具体样本数量、细胞数目、测序平台、读长、基因表达矩阵格式等信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ncbi.nlm.nih.gov,源站对其的描述为:对携带His36Tyr突变的ADTKD-Umod小鼠肾脏进行单细胞RNA转录组测序。数据集的采集物种为小鼠,采集组织为肾脏,采集对象为携带特定突变(His36Tyr)的ADTKD-Umod模型。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、动物饲养条件、测序服务提供方等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可适用于以下方向:一是研究ADTKD-Umod小鼠肾脏在单细胞层面的转录组特征;二是比较肾脏组织内不同细胞群体的基因表达差异,探索与His36Tyr突变相关的细胞状态改变;三是作为遗传性肾脏疾病单细胞测序研究的参考数据,用于方法学验证或与其他肾脏单细胞数据集进行对照分析。需要说明的是,上述场景系依据数据集的测序对象与测序类型所作的一般性说明,源站未提供针对该数据集的具体应用案例或分析结论。

【使用方法】

该数据集可通过ncbi.nlm.nih.gov获取,检索时可使用数据集英文名中的编号标识PRJDB44124或PRJCA052788。使用时应结合源站提供的项目信息了解数据组织方式。关于数据下载的具体路径、文件格式说明、配套的分析流程或代码、是否需要专门工具处理等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单细胞RNA转录组测序数据,其质量评估指标(如测序深度、细胞存活率、比对率等)源站未提供。限制方面,该数据集基于小鼠模型且仅涉及携带His36Tyr突变的ADTKD-Umod背景,向其他物种或其他突变类型的推广需谨慎;数据覆盖的样本范围与生物学重复情况源站未提供,因此无法据此判断其统计效力。此外,源站描述仅提及肾脏单细胞转录组测序,未说明是否包含其他组学层面或验证实验数据。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、作者信息、发表文献及许可条款源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应前往ncbi.nlm.nih.gov查阅该数据集对应页面的最新说明,以获取准确的引用要求与使用许可信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB44124

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

His36Tyr突变ADTKD-Umod小鼠肾脏的单细胞RNA转录组测序

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案