Name: 胎儿左心室流出道梗阻妊娠的胎盘转录组差异数据集
Creator: Texas Data Repository

基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-19

资源简介

胎儿左心室流出道梗阻妊娠的胎盘转录组差异数据集

该数据集聚焦于胎儿左心室流出道梗阻（LVOTO）这一先天性心脏缺陷与胎盘转录组之间的关系，收录了来自足月胎盘存档福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的bulk RNA测序数据。样本由两组构成：伴或不伴胎盘病理的LVOTO妊娠样本共20例，以及健康对照样本10例。研究者通过比较这两组胎盘的转录组特征，检验胎儿LVOTO是否与独特的转录组状态和细胞状态相关联。数据集以英文命名，归入妊娠、分娩和产褥期/其他类别，由Udayakumar, Durga提交至Texas Data Repository，发布时间为2026年，主题标签为Medicine, Health and Life Sciences。

【数据集背景】

胎儿左心室流出道梗阻是一类先天性心脏流出道异常。该数据集的研究出发点在于考察胎儿LVOTO是否与胎盘的转录组及细胞状态存在特异性关联。为此，研究以足月胎盘为对象，借助bulk RNA测序从转录组层面比较LVOTO妊娠与健康对照之间的差异，并同时纳入伴或不伴胎盘病理的LVOTO样本，以便在分析中考虑胎盘病理因素的存在。

【数据内容】

数据集的核心内容是来自足月胎盘存档FFPE组织的bulk RNA测序数据。样本构成包括：LVOTO妊娠样本20例（其中包含伴胎盘病理与不伴胎盘病理的情形），以及健康对照样本10例。数据所覆盖的生物学对象为胎盘组织的整体转录组，测序类型为bulk RNA测序，组织来源为存档FFPE样本。源站未提供关于测序平台、读长、数据文件格式、文件数量与体积、基因表达矩阵或原始计数等更细粒度的技术信息。

【采集与来源】

样本取自足月胎盘的存档FFPE组织，属于回顾性存档样本的利用方式。样本分组依据为妊娠是否合并胎儿LVOTO，并在LVOTO组内区分是否伴有胎盘病理，同时设置健康对照组。数据集由Udayakumar, Durga提交，存放于Texas Data Repository，来源站为doi.org，发布时间为2026年。源站未提供样本采集时间跨度、具体医疗机构、伦理审批信息及测序服务提供方等细节。

【适用场景】

该数据集适用于研究与胎儿LVOTO相关的胎盘转录组改变，也可用于探讨胎盘病理状态对转录组特征的影响，以及比较LVOTO妊娠与健康妊娠在胎盘整体转录组层面的差异。对于关注先天性心脏缺陷与胎盘生物学关联的研究者，该数据可作为二次分析的素材。由于数据来自FFPE存档组织，亦可供方法学层面讨论FFPE来源RNA测序数据利用的参考。源站未提供该数据集在其他具体研究场景中的应用说明。

【使用方法】

使用时应以LVOTO妊娠组（20例）与健康对照组（10例）的分组为基础开展比较分析，并注意LVOTO组内伴或不伴胎盘病理的构成差异。由于样本来源于FFPE存档组织，分析中需考虑该类组织对RNA质量与表达检测的潜在影响。源站未提供数据处理流程、标准化方法、质控参数及分析代码等操作层面的说明，使用者在分析前需自行确认数据文件的具体组织形式。

【质量与限制】

数据集基于存档FFPE胎盘组织，样本量分别为LVOTO组20例与对照组10例，对照组规模相对有限。LVOTO组内混合了伴与不伴胎盘病理的样本，分析时需对胎盘病理这一因素加以考虑。源站未提供测序深度、数据完整性、批次信息、质控结果及缺失值情况等质量相关指标，也未提供对该数据集局限性的官方说明。

【引用与许可】

数据集英文名称为Placental Transcriptomes Differ in Human Pregnancies Complicated by Fetal Left Ventricular Outflow Tract Obstruction，作者为Udayakumar, Durga，存放机构为Texas Data Repository，来源站为doi.org，发布时间为2026年。源站未提供具体的许可协议条款与推荐引用格式，使用者在引用与再利用前应向数据存放机构核实授权条件。

原始链接

https://doi.org/10.18738/T8/DS9WZA

访问原始数据

下载信息

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数据集获取

源站：https://doi.org/10.18738/T8/DS9WZA

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含从足月胎盘存档FFPE组织中获得的bulk RNA测序数据[LVOTO妊娠（n=20，伴/不伴胎盘病理）和健康对照（n=10）]，用于检验胎儿LVOTO是否与独特的转录组和细胞状态相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别