恩杂鲁胺治疗期间序贯前列腺转移灶与配对患者来源异种移植瘤的突变图谱

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 17 个文件,围绕一例在雄激素剥夺治疗进展后、开始恩杂鲁胺化疗前治疗的患者,从其转移性肋骨病灶获取组织活检,在恩杂鲁胺治疗前后十二周内进行测序,并皮下及肾包膜下植入免疫缺陷小鼠建立患者来源异种移植瘤模型

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2023-06-11 更新
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基因组分类Sequential Prostate Metastasespatient tumor tissuesprostate cancer stagecopy number variationsandrogen deprivation therapyMatched Patient Derived Xenograftsmetastatic rib lesionmetastatic tumor expression signaturexenograft modelsunderstanding tumor progressionmetastatic tumor tissues
Mutational Landscapes of Sequential Prostate Metastases and Matched Patient Derived Xenografts during Enzalutamide Therapy

基本信息

模态
基因组
大小
0.022809687 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-11
版本
v1

资源简介

恩杂鲁胺治疗期间序贯前列腺转移灶与配对患者来源异种移植瘤的突变图谱

Mutational Landscapes of Sequential Prostate Metastases and Matched Patient Derived Xenografts during Enzalutamide Therapy

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 17 个文件,围绕一例在雄激素剥夺治疗进展后、开始恩杂鲁胺化疗前治疗的患者,从其转移性肋骨病灶获取组织活检,在恩杂鲁胺治疗前后十二周内进行测序,并皮下及肾包膜下植入免疫缺陷小鼠建立患者来源异种移植瘤模型。数据涵盖转移灶与配对异种移植瘤的基因组和转录组图谱,可用于研究晚期前列腺癌的生物学异质性、突变景观与肿瘤进展,支持个体化治疗探索(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Mutational Landscapes of Sequential Prostate Metastases and Matched Patient Derived Xenografts during Enzalutamide Therapy》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0145176。源站首次发布:2016-01-05。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):从个体肿瘤开发患者来源模型以捕捉晚期前列腺癌的生物学异质性和突变景观具有挑战性,但对于理解肿瘤进展以及在转移性去势抵抗性前列腺癌阶段实施个体化治疗至关重要。为证明在该阶段开发患者来源异种移植瘤模型的可行性,我们呈现一个案例研究,其中异种移植瘤来源于一名在接受雄激素剥夺治疗期间进展、且尚未开始化疗前恩杂鲁胺治疗的患者身上的癌症转移灶。在开始恩杂鲁胺治疗前后十二周期间,获取转移性肋骨病灶的组织活检用于测序,并皮下及肾包膜下植入免疫缺陷小鼠。异种移植瘤的基因组和转录组景观

【数据结构与技术规格】

文件数 17 个,合计 22.81 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0145176。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:Sequential Prostate Metastases、patient tumor tissues、prostate cancer stage、copy number variations、androgen deprivation therapy、Matched Patient Derived Xenografts、metastatic rib lesion、metastatic tumor expression signature、xenograft models、understanding tumor progression。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Mutational_Landscapes_of_Sequential_Prostate_Metastases_and_Matched_Patient_Derived_Xenografts_during_Enzalutamide_Therapy_/1628968

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Kohli, Manish; Wang, Liguo; Xie, Fang; Sicotte, Hugues; Yin, Ping; M. Dehm, Scott; et al. (2016). Mutational Landscapes of Sequential Prostate Metastases and Matched Patient Derived Xenografts during Enzalutamide Therapy. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-11,引用时请注意版本时效。

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文件清单

  • S1_Fig.tif(11.29 MB)
  • S2_Fig.tif(636.98 KB)
  • S3_Fig.tif(902.16 KB)
  • S4_Fig.tif(707.55 KB)
  • S5_Fig.tif(758.74 KB)
  • S6_Fig.tif(1.01 MB)
  • S7_Fig.tif(6.86 MB)
  • S8_Fig.tif(503.07 KB)
  • S1_Table.xlsx(11.56 KB)
  • S2_Table.xlsx(10.72 KB)
  • S3_Table.xlsx(9.91 KB)
  • S4_Table.xlsx(10.30 KB)
  • S5_Table.xlsx(10.15 KB)
  • S6_Table.xlsx(10.91 KB)
  • S7_Table.xlsx(9.80 KB)
  • S8_Table.xlsx(57.63 KB)
  • S1_Animal_Methods.docx(14.50 KB)

文件总体积 22.81 MB(源站 API 实测)。

数据说明

从个体肿瘤开发患者来源模型,以捕捉晚期前列腺癌的生物学异质性和突变图谱,具有挑战性,但对于理解肿瘤进展以及在转移性去势抵抗性前列腺癌阶段实施个性化治疗至关重要。为证明在该阶段开发患者来源异种移植模型的可行性,我们呈现一例病例研究,其中异种移植源自一名在接受雄激素剥夺治疗期间疾病进展、且尚未开始化疗前恩杂鲁胺治疗患者的癌症转移灶。在开始恩杂鲁胺治疗前后的十二周期间,获取转移性肋骨病灶的组织活检用于测序,并同时皮下及肾包膜下植入免疫缺陷小鼠。通过对两个时间点的转移性肿瘤组织和异种移植进行全外显子组和转录组测序,比较了异种移植与原始患者肿瘤组织的基因组和转录组图谱。

在比较了体细胞突变、拷贝数变异、基因融合和基因表达之后,我们发现患者来源的异种移植瘤中高度保真地保留了患者的基因组和转录组改变。这些异种移植模型为预测现有及潜在新药的疗效提供了机会,其预测基于个体转移性肿瘤的表达特征和分子药理学,以推动精准医疗的实施。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0145176(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Mutational_Landscapes_of_Sequential_Prostate_Metastases_and_Matched_Patient_Derived_Xenografts_during_Enzalutamide_Therapy_/1628968)。

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