肾脏病理图像分割(KPIs)挑战赛数据集

包含来自60多张PAS染色全切片图像的超过10,000个肾小球标注,用于肾脏病理图像分割,涵盖正常和多种CKD小鼠模型。

范德比尔特大学, 纳什维尔, 田纳西州 37215, 美国范德比尔特大学, 纳什维尔, 田纳西州 37215, 美国
arXiv
2025-02-11 更新
浏览 24
医学影像慢性肾病医学图像分割
Kidney Pathology Image Segmentation (KPIs) Challenge Dataset

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2025-02-11

资源简介

肾脏病理图像分割(KPIs)挑战赛数据集

【数据内容】

源站原始描述:Segment instances of microvascular structures from healthy human kidney tissue slides

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):从健康人类肾脏组织切片中分割微血管结构的实例。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-hacking-the-human-vasculature/data

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使用方式

数据集获取

方式一:KaggleHub(Python,推荐 AI Agent 使用)

# 前置依赖: pip install kagglehub
import kagglehub

path = kagglehub.competition_download("hubmap-hacking-the-human-vasculature")
print("比赛数据已下载至:", path)

方式二:Kaggle CLI(命令行)

# 前置条件: 注册 Kaggle 账号, Settings > API > Create New Token
# 将 kaggle.json 放到 ~/.kaggle/ 并 chmod 600
pip install kaggle
kaggle competitions download -c hubmap-hacking-the-human-vasculature

数据说明

该数据集由范德比尔特大学组织,包含来自60多张过碘酸希夫(PAS)染色全切片图像的超过10,000个已注释的肾小球,涵盖正常和多种慢性肾病(CKD)模型的预临床小鼠模型,用于肾脏病理图像分割任务,旨在推动疾病研究和诊断。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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