不同免疫抑制方案下肾移植患者肾小管功能障碍的移植物内转录谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-48250

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究调查了肾小管功能障碍患者的移植物内转录谱，以揭示移植肾功能恶化的亚临床机制。此外，我们分析了在调整治疗方案12个月后，个体化免疫抑制治疗是否能改变这一转录谱，同时改善肾功能。研究纳入了33名肾移植患者，因其尿中视黄醇结合蛋白水平高，这是近端肾小管功能障碍（PTD）的生物标志物。根据免疫抑制治疗，患者被分为两组。在基线时（t0），33名患者接受了活检，其中18名患者的免疫抑制方案进行了调整，即减少环孢素剂量并引入霉酚酸酯（MYF），而15名患者继续使用硫唑嘌呤（AZA）方案。所有患者随访12个月（t12），随后再次进行活检。对17名患者的活检样本进行了微阵列实验。通过转录网络分析，解释了因尿视黄醇结合蛋白水平升高及免疫抑制治疗引起的分子变化。本数据集是TransQST集合的一部分。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。