整合转录组与甲基化组解析原发性醛固酮增多症分子发病机制：醛固酮腺瘤与邻近肾上腺组织的比较
该数据集来自 ebi.ac.uk，属于泌尿生殖系统疾病/其他分类，主题涉及甲基化芯片分析与转录组芯片分析，物种为 Homo sapiens
基本信息
资源简介
整合转录组与甲基化组解析原发性醛固酮增多症分子发病机制：醛固酮腺瘤与邻近肾上腺组织的比较
该数据集英文名称为 Integration of transcriptome and methylome analyses to dissect molecular pathogenesis of primary aldosteronism: comparision between aldosterone-producing adenomas and adjacent adrenal glands，来源站为 ebi.ac.uk，在本站归入泌尿生殖系统疾病 / 其他分类。其主题标签涵盖 methylation profiling by array、transcription profiling by array 以及 Homo sapiens，说明该数据集围绕人类样本，结合甲基化芯片分析与转录组芯片分析两类技术手段，用于研究原发性醛固酮增多症的分子发病机制，并对醛固酮 producing 腺瘤与邻近肾上腺组织进行比较。源站将其描述为一个 SuperSeries，由若干 SubSeries 组成，具体信息需参考各个子系列。整体而言，该数据集属于以芯片为基础的多组学整合型资源，服务于内分泌与泌尿生殖系统疾病相关研究。
【数据集背景】
原发性醛固酮增多症是肾上腺疾病领域的重要研究方向，其分子层面的发病机制涉及转录水平与表观遗传水平的多种变化。该数据集以醛固酮 producing 腺瘤与邻近肾上腺组织之间的比较为切入点，试图通过整合转录组与甲基化组两类数据，剖析疾病发生发展中的分子特征。数据集名称中明确体现了“整合转录组与甲基化组分析以解析原发性醛固酮增多症分子发病机制”的主旨，并强调腺瘤与邻近肾上腺组织之间的对照比较。这一设计思路使其区别于单一组学数据集，具备多层面分子信息联合考察的定位。
【数据内容】
该数据集包含的主题类型为甲基化芯片分析与转录组芯片分析，物种为 Homo sapiens。源站将其组织为一个 SuperSeries，由若干 SubSeries 构成，但源站描述中仅指出“本 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成，请参考各个 Series”，并未逐一列出子系列的具体内容、样本数量、芯片平台型号或数据文件构成。因此，关于数据内容的具体规模、样本分组细节、数据文件格式与数量等信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。根据主题标签，其数据采集涉及人类样本的甲基化芯片检测与转录组芯片检测。关于样本采集的具体地点、时间范围、伦理审批信息、样本纳入与排除标准等，源站未提供。数据集名称中提及醛固酮 producing 腺瘤与邻近肾上腺组织的比较，表明样本类型涉及肾上腺腺瘤组织及邻近肾上腺组织，但具体样本数量与临床信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于原发性醛固酮增多症分子发病机制的研究场景，尤其是需要同时考察转录组变化与 DNA 甲基化变化的研究。其腺瘤与邻近肾上腺组织的比较设计，可用于探索疾病相关组织中转录水平与表观遗传修饰之间的关联。此外，该数据集也可作为泌尿生殖系统疾病 / 其他分类下多组学整合分析的参考资源，供内分泌学、肾上腺疾病研究以及表观遗传学相关分析使用。关于更具体的适用分析类型与方法，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 SuperSeries 形式组织，使用时需参考其所包含的各个 SubSeries。源站描述明确提示“请参考各个 Series”，表明具体的数据下载、处理与分析应依据子系列进行。关于数据文件的获取方式、预处理流程、分析工具与参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为芯片为基础的多组学整合资源，其质量信息如数据完整性、重复性、批次效应评估等，源站未提供。由于源站描述仅说明 SuperSeries 由 SubSeries 组成而未展开细节，使用者在缺乏子系列具体说明的情况下，可能难以直接判断数据规模与适用范围。此外，数据集名称中存在“comparision”拼写形式，引用时宜以源站名称为准。关于数据的具体限制与注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应参考 ebi.ac.uk 源站的相关规定与各 SubSeries 的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-60044
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Kazuhiko Nakabayashi (2015). Integration of transcriptome and methylome analyses to dissect molecular pathogenesis of primary aldosteronism: comparision between aldosterone-producing adenomas and adjacent adrenal glands [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-60044
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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