IDR idr0148-schumacher-kidneytem 实验A 肾脏组织成像数据集

主题标签:泌尿生殖系统疾病、肾脏组织、细胞成像、组织成像、IDR、OME/EMBL-EBI。本站分类:泌尿生殖系统疾病。本数据集为泌尿生殖系统疾病领域公开数据集,主题涵盖泌尿生殖系统疾病。

idr
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医学影像泌尿生殖系统疾病肾脏组织细胞成像组织成像IDROME/EMBL-EBI
IDR idr0148-schumacher-kidneytem (experimentA)

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

IDR idr0148-schumacher-kidneytem 实验A 肾脏组织成像数据集

IDR idr0148-schumacher-kidneytem(experimentA)是一个来自 Image Data Resource(IDR)的公开细胞与组织成像研究数据集,收录于 idr.openmicroscopy.org,本站将其归类于泌尿生殖系统疾病 / 其他。该数据集围绕肾脏组织与细胞成像、组织成像主题组织影像材料,共包含 10 幅图像,属于经策展的细胞/组织成像研究,由 OME/EMBL-EBI 体系维护。作为泌尿生殖系统疾病领域的公开数据资源,它面向肾脏相关组织与细胞的显微成像观察,可用于了解该研究方向下的影像数据组织方式与内容构成,并为相关领域的影像分析、方法比较与教学展示提供可访问的数据入口。

【数据集背景】

该数据集对应 IDR 研究编号 idr0148-schumacher-kidneytem 中的 experimentA 实验部分。IDR(Image Data Resource)是面向细胞与组织成像研究的策展型数据资源,由 OME/EMBL-EBI 提供支持,其收录内容以经过整理和组织的显微成像研究为主。本站将该数据集归入泌尿生殖系统疾病类别,主题标签涵盖泌尿生殖系统疾病、肾脏组织、细胞成像、组织成像、IDR 以及 OME/EMBL-EBI,说明其内容定位于肾脏组织与细胞层面的成像研究,服务于泌尿生殖系统疾病相关方向的公开数据需求。

【数据内容】

该数据集共包含 10 幅图像,实验标识为 experimentA。影像内容围绕肾脏组织与细胞成像展开,属于组织成像与细胞成像相结合的研究材料。除图像数量与主题指向外,源站未提供关于图像尺寸、通道数、分辨率、染色方式、样本数量或分组设计的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 官方站点,源站将其描述为经策展的细胞/组织成像研究(OME/EMBL-EBI)。数据集的英文名称为 IDR idr0148-schumacher-kidneytem (experimentA)。关于具体的显微成像设备、物镜参数、曝光条件、样本制备流程与采集时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于泌尿生殖系统疾病领域中与肾脏组织、细胞成像和组织成像相关的观察与研究场景,可作为公开影像资源用于方法演示、影像浏览、教学展示以及与其他成像数据的对照参考。由于其为经策展的公开成像研究,也适合作为数据组织与元数据实践的示例。关于具体分析任务(如分割、配准、定量测量)的适用性,源站未提供说明。

【使用方法】

该数据集可通过 IDR 站点(idr.openmicroscopy.org)按研究编号 idr0148-schumacher-kidneytem 及实验标识 experimentA 进行访问与浏览。关于下载格式、图像导出方式、API 调用方法及配套分析工具的具体指引,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 收录的策展型成像研究,图像数量为 10 幅。除上述信息外,源站未提供关于图像质量评估、数据完整性、标注情况、批次差异或已知技术限制的说明,使用时应结合源站页面自行核实。

【引用与许可】

该数据集来自 Image Data Resource(OME/EMBL-EBI),引用时应遵循 IDR 站点的引用规范。关于具体许可条款、使用限制与推荐引用格式,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2651

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0148-schumacher-kidneytem. Experiment: experimentA. Images: 10. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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