IDR idr0116-deboer-npod 数据集(experimentA)

主题标签:泌尿生殖系统疾病、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:泌尿生殖系统疾病/其他。本数据集为泌尿生殖系统疾病领域公开数据集,主题涵盖泌尿生殖系统疾病。

idr
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图像泌尿生殖系统疾病细胞成像组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0116-deboer-npod (experimentA)

基本信息

模态
图像
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

IDR idr0116-deboer-npod 数据集(experimentA)

IDR idr0116-deboer-npod(experimentA)是一个来自 Image Data Resource(IDR)的公开细胞与组织成像研究数据集,收录于 idr.openmicroscopy.org。该数据集在本站归入泌尿生殖系统疾病/其他类别,主题涵盖泌尿生殖系统疾病、细胞成像与组织成像,并关联 IDR、OME、EMBL-EBI 等开放生物成像基础设施。数据集包含 4 幅图像,属于经过策展的细胞/组织成像研究,面向泌尿生殖系统疾病领域的观察与研究需求,提供可公开访问的成像数据资源。

【数据集背景】

该数据集源自 IDR 平台上的研究条目 idr0116-deboer-npod,实验标识为 experimentA。IDR 是面向细胞与组织成像研究的策展型数据资源,依托 OME 与 EMBL-EBI 的开放数据体系,对成像研究进行整理与公开。本数据集即属于这一体系下的泌尿生殖系统疾病相关成像研究,本站将其归入泌尿生殖系统疾病/其他分类,主题标签包括泌尿生殖系统疾病、细胞成像、组织成像、IDR、OME 与 EMBL-EBI。

【数据内容】

数据集包含 4 幅图像,属于细胞/组织成像研究数据。图像以 OME 体系组织与描述,属于经过策展的成像研究内容。除图像数量与成像类型外,源站未提供关于样本类型、染色方式、成像模态、分辨率或通道构成等更细粒度的内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 idr.openmicroscopy.org 上的 IDR 研究条目 idr0116-deboer-npod,实验为 experimentA。该条目属于 Image Data Resource 的策展细胞/组织成像研究集合,与 OME、EMBL-EBI 的开放生物成像数据生态相关联。关于具体的样本采集流程、仪器设备、成像参数与实验条件,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集适用于泌尿生殖系统疾病领域的细胞与组织成像观察,也可用于了解 IDR 平台上策展型成像研究的组织方式。由于数据以 OME 体系描述,适合在支持 OME 图像与元数据读取的成像分析环境中查看与处理。关于该数据集在具体研究问题上的适用性,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集可通过 IDR 站点 idr.openmicroscopy.org 上的对应研究条目访问,实验标识为 experimentA。使用者可依据 IDR 平台提供的浏览与下载方式获取图像数据,并在支持 OME 数据模型的软件中打开与分析。关于具体的下载格式、访问权限设置或分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 上的策展成像研究,包含 4 幅图像。其内容范围有限,仅覆盖该研究条目下的 experimentA 实验。关于图像质量评估、元数据完整度、批次效应或潜在偏差等信息,源站未提供。使用者应结合自身研究目的判断其适用性。

【引用与许可】

该数据集来自 IDR(idr.openmicroscopy.org),关联 OME 与 EMBL-EBI。关于具体的引用格式、作者信息与许可条款,源站未提供。使用与再分发时应遵循源站的相关规定。

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下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2053

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0116-deboer-npod. Experiment: experimentA. Images: 4. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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