工程化报告氧化应激的人iPSC来源肾类器官可预测药物诱导肾毒性

数据集获取

源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/4372

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

再生医学的进展已促成许多类型类器官的构建，这些类器官再现了内源性器官的重要特征，但其本身可能有限或结构紊乱。尽管它们用于恢复功能的价值仍不明确，但它们在研究、诊断和毒理学中无疑具有价值。在毒理学中，迫切需要更好的人类肾脏模型。我们利用人iPS细胞（hiPSC）来源的肾类器官，鉴定出HMOX1可作为通过氧化应激通路反映毒性应激的有用标志物，随后在hiPSC中构建了HMOX1报告基因。我们使用两种形式的hiPSC来源HMOX1报告基因肾类器官，在一组盲法编码的化合物中探究其检测肾毒性物质的能力。我们的结果突显了HMOX1报告基因肾类器官作为筛选工具的潜在用途及一些局限性。这些结果可能为其他干细胞来源器官和组织开发类似的应激报告类器官检测方法提供指导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。