受原发性色素结节性肾上腺皮质病影响的人肾上腺皮质

该数据集来自 ebi.ac.uk,比较健康青少年女性的人肾上腺皮质与由 PRKAR1a 胚系突变导致的原发性色素结节性肾上腺皮质病患者的肾上腺皮质,采用 SAGE 方法进行转录谱分析,物种为 Homo sapiens

biostudies
浏览 12
基因组分类transcription profiling by SAGEHomo sapiens
Human Adrenal Cortex affected by Primary Pigmented Nodular Adrenocortical Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

受原发性色素结节性肾上腺皮质病影响的人肾上腺皮质

该数据集名为 Human Adrenal Cortex affected by Primary Pigmented Nodular Adrenocortical Disease,收录于 ebi.ac.uk,归入泌尿生殖系统疾病 / 其他类别。它围绕人肾上腺皮质展开,将健康青少年女性的肾上腺皮质与由 PRKAR1a 胚系突变导致的原发性色素结节性肾上腺皮质病患者的肾上腺皮质进行对比,采用 SAGE(基因表达系列分析)方法开展转录谱分析,物种为 Homo sapiens。数据集的主题标签为 transcription profiling by SAGE 与 Homo sapiens,核心价值在于从转录本层面呈现疾病状态与健康状态之间的差异,为理解该罕见肾上腺疾病的分子特征提供数据基础。

【数据集背景】

原发性色素结节性肾上腺皮质病是一种与 PRKAR1a 胚系突变相关的肾上腺皮质疾病。该数据集以青少年女性为研究对象,将健康青少年女性的肾上腺皮质与患病青少年女性的肾上腺皮质并置比较,试图在转录水平上刻画疾病对肾上腺皮质基因表达的影响。源站描述明确指出,这一比较针对的是由 PRKAR1a 胚系突变所致的原发性色素结节性肾上腺皮质病,关键词标注为 other。

【数据内容】

数据集的内容属于转录谱数据,采用 SAGE 方法产生,主题标签为 transcription profiling by SAGE,物种为 Homo sapiens。其设计核心是两组人肾上腺皮质样本之间的表达谱比较:一组来自健康青少年女性,另一组来自患原发性色素结节性肾上腺皮质病的青少年女性。源站未提供样本数量、测序标签数目、表达标签的具体统计结果等细节。

【采集与来源】

数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述说明,比较的对象是人肾上腺皮质,分别取自青少年女性与患原发性色素结节性肾上腺皮质病的青少年女性,后者由 PRKAR1a 胚系突变引起。除上述来源与样本来源信息外,源站未提供具体的采集流程、伦理审批信息与样本处理细节。

【适用场景】

该数据集适用于在转录水平上比较健康与患病肾上腺皮质的研究场景,可用于探索 PRKAR1a 胚系突变相关原发性色素结节性肾上腺皮质病的基因表达特征,也可作为 SAGE 转录谱分析在肾上腺疾病研究中的应用示例。由于数据仅涉及青少年女性样本,其适用范围应限定在这一人群与这一疾病背景之内。源站未提供其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

数据集采用 SAGE 方法进行转录谱分析,使用者可据此对两组样本的转录谱进行比较研究。源站未提供数据文件格式、下载方式、分析流程与软件工具等具体使用说明。

【质量与限制】

该数据集聚焦于单一疾病与单一性别、年龄段的样本比较,样本背景较为集中。源站未提供样本量、数据覆盖度、重复性验证与质量控制指标等信息,因此无法对数据质量作出进一步判断。使用时应结合源站描述所限定的比较范围理解结果。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-2055

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-2055 受原发性色素结节性肾上腺皮质病影响的人肾上腺皮质,通过SAGE进行转录组分析,智人。比较来源于青少年女性的人肾上腺皮质与来源于受原发性色素结节性肾上腺皮质病影响的青少年女性的人肾上腺皮质。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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