Zfp36l3野生型与敲除型滋养层干细胞及胎盘基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE79767

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ZFP36L3蛋白是tristetraprolin（TTP）家族CCCH串联锌指蛋白中的一个啮齿类特异性成员，特异表达于胎盘和卵黄囊。这些蛋白结合靶mRNA中的AU富集元件，促进其去腺苷酸化和降解。我们验证了以下假设：ZFP36L3缺失会导致靶转录本在胎盘和/或卵黄囊中积累，且其中部分转录本对雌性生殖生理和整体繁殖力具有重要作用。ZFP36L3缺陷小鼠表现出新生仔存活率降低，但胎盘或存活子代未见明显形态学改变。我们发现Zfp36l3为父源印记基因，其基因表达受到亲本来源的深刻影响。该蛋白在胎盘迷路层的合体滋养层细胞及卵黄囊上皮细胞中高表达。对Zfp36l3敲除小鼠胎盘mRNA进行RNA-Seq分析，揭示了许多显著上调的转录本，而敲除小鼠卵黄囊中变化甚少。许多上调的胎盘转录本在源自敲除囊胚的分化滋养层干细胞中表现出降解速率降低。

数十份转录本被认定为ZFP36L3的高概率靶标；这些转录本包括已知参与滋养层和胎盘生理功能的蛋白质。令人意外的是，尽管在KO干细胞中其稳定性增加，1型转铁蛋白受体mRNA在KO胎盘中的表达却下降了。该受体对胎盘铁摄取至关重要，其减少伴随着KO胎儿体内铁储备的下降，提示这种宫内缺乏可能对后期生活产生不利影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。