与卵母细胞发育能力相关的颗粒细胞基因表达
该数据集来自 NCBI,包含大鼠卵巢卵泡颗粒细胞的基因表达谱,使用 Affymetrix 大鼠全基因组芯片检测。比较正常发育能力组与发育能力低下组后发现,12 个基因上调、1 个基因下调超过 1.5 倍,涉及蛋白赖氨酸 6 氧化酶活性调控、凋亡诱导及细胞外基质组织与生物合成等过程

基本信息
资源简介
与卵母细胞发育能力相关的颗粒细胞基因表达
Granulosa cell gene expression associated with oocyte developmental competence
该数据集来自 NCBI,包含大鼠卵巢卵泡颗粒细胞的基因表达谱,使用 Affymetrix 大鼠全基因组芯片检测。比较正常发育能力组与发育能力低下组后发现,12 个基因上调、1 个基因下调超过 1.5 倍,涉及蛋白赖氨酸 6 氧化酶活性调控、凋亡诱导及细胞外基质组织与生物合成等过程。数据可用于研究颗粒细胞基因表达与卵母细胞发育能力的关系,并支持差异表达基因筛选与功能分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 03 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):用 Affymetrix 大鼠全基因组芯片检测大鼠卵巢卵泡颗粒细胞的基因表达谱,结果显示,与发育能力低下组相比,正常发育能力组中有 12 个基因上调、1 个基因下调超过 1.5 倍。基因本体分类显示,上调基因包括赖氨酰氧化酶和神经生长因子受体相关蛋白 1,二者分别对蛋白赖氨酸 6 氧化酶活性的调控和凋亡诱导具有重要作用。下调基因包括糖蛋白-4-β 半乳糖基转移酶 2,其参与细胞外基质组织与生物合成的调控。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1355、10116。本站分类:泌尿生殖系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7697
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 31 201,引用时请注意版本时效。
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数据说明
采用Affymetrix大鼠全基因组芯片检测大鼠卵巢卵泡颗粒细胞的基因表达谱,结果显示,与发育能力差组相比,发育能力正常组中有12个基因表达上调,1个基因表达下调超过1.5倍。基因本体分类显示,上调基因包括赖氨酰氧化酶和神经生长因子受体相关蛋白1,二者分别在蛋白-赖氨酸6-氧化酶活性调控和细胞凋亡诱导中具有重要作用。下调基因包括糖蛋白-4-β半乳糖基转移酶2,其参与细胞外基质组织与生物发生的调控。关键词:剂量反应
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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