野生型与Zfp36l3敲除小鼠卵黄囊组织基因表达差异
该数据集来自NCBI GEO,比较野生型与Zfp36l3敲除小鼠卵黄囊组织的基因表达差异,采用高通量测序进行表达谱分析。ZFP36L3是啮齿类特有的、胎盘和卵黄囊特异性的TTP家族CCCH串联锌指蛋白成员,结合靶mRNA的AU富集元件并促进其去腺苷酸化和降解

基本信息
资源简介
野生型与Zfp36l3敲除小鼠卵黄囊组织基因表达差异
Gene expression differences in yolk sac tissue between wild-type and Zfp36l3 knockout mice
该数据集来自NCBI GEO,比较野生型与Zfp36l3敲除小鼠卵黄囊组织的基因表达差异,采用高通量测序进行表达谱分析。ZFP36L3是啮齿类特有的、胎盘和卵黄囊特异性的TTP家族CCCH串联锌指蛋白成员,结合靶mRNA的AU富集元件并促进其去腺苷酸化和降解。数据可用于研究Zfp36l3父源印记对基因表达的亲本来源效应,以及该基因缺失对胎盘铁摄取相关转录本(如1型转铁蛋白受体mRNA)的影响(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 20 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):ZFP36L3蛋白是啮齿类特有的、胎盘和卵黄囊特异性的tristetraprolin(TTP)家族CCCH串联锌指蛋白成员。这些蛋白结合靶mRNA中的AU富集元件,并促进其去腺苷酸化和降解。ZFP36L3缺陷小鼠表现出新生小鼠存活率降低,但胎盘或存活后代未见明显形态学改变。Zfp36l3为父源印记,对基因表达具有深刻的亲本来源效应。对KO胎盘mRNA的RNASeq揭示了许多显著受影响的转录本,其中一些在源自KO囊胚的分化滋养层干细胞中表现出降解速率降低。1型转铁蛋白受体mRNA在KO胎盘中意外降低,尽管其稳定性增加。该受体对胎盘从母体循环摄取铁至关重要,其d
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL13112、10090。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66138
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数据说明
ZFP36L3蛋白是tristetraprolin(TTP)家族CCCH串联锌指蛋白中的一个啮齿类动物特异性成员,特异表达于胎盘和卵黄囊。这些蛋白与靶mRNA中的AU富集元件结合,促进其去腺苷酸化和降解。ZFP36L3缺陷小鼠的新生儿存活率降低,但胎盘或存活子代未见明显的形态学改变。Zfp36l3为父源印记基因,对基因表达具有深远的亲本来源效应。对敲除(KO)胎盘mRNA进行RNASeq分析,发现许多转录本受到显著影响,其中部分转录本在来源于KO囊胚的分化滋养层干细胞中降解速率降低。1型转铁蛋白受体mRNA在KO胎盘中意外降低,尽管其稳定性增加。该受体对胎盘从母体循环中摄取铁至关重要,其降低伴随KO胎儿铁储备减少,提示这种宫内缺乏可能在后期生活中产生有害后果。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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