野生型与Zfp36l3敲除小鼠胎盘组织基因表达差异数据集
该数据集来自 NCBI GEO,包含野生型与 Zfp36l3 敲除小鼠胎盘组织的基因表达数据,采用高通量测序进行表达谱分析

基本信息
资源简介
野生型与Zfp36l3敲除小鼠胎盘组织基因表达差异数据集
Gene expression differences in mouse placenta tissue bewteen wild-type and Zfp36l3 knockout mice
该数据集来自 NCBI GEO,包含野生型与 Zfp36l3 敲除小鼠胎盘组织的基因表达数据,采用高通量测序进行表达谱分析。ZFP36L3 是啮齿类特有的胎盘和卵黄囊特异性蛋白,属于 TTP 家族,可结合 mRNA 的 AU 富集元件并促进其脱腺苷化和降解。敲除小鼠新生存活率下降,但胎盘形态无明显改变,且 Zfp36l3 呈父源印记。数据可用于比较基因表达差异、研究印记效应及胎盘铁转运相关转录本变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 20 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):ZFP36L3 蛋白是啮齿类特有的、胎盘和卵黄囊特异性的 tristetraprolin(TTP)家族 CCCH 串联锌指蛋白成员。这些蛋白结合靶 mRNA 中的 AU 富集元件,并促进其脱腺苷化和降解。ZFP36L3 缺陷小鼠表现出新生存活率下降,但胎盘或存活后代无明显形态学改变。Zfp36l3 呈父源印记,对基因表达具有深刻的亲本来源效应。对敲除胎盘 mRNA 的 RNASeq 揭示了许多显著受影响的转录本,其中一些在源自敲除囊胚的分化滋养层干细胞中表现出降解速率降低。1 型转铁蛋白受体 mRNA 在敲除胎盘中意外降低,尽管其稳定性增加。该受体对于胎盘从母体循环摄取铁至关重要,其 d
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL9250、10090。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66137
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。
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数据说明
ZFP36L3蛋白是tristetraprolin(TTP)家族CCCH串联锌指蛋白中的一个啮齿类动物特异性成员,特异表达于胎盘和卵黄囊。这些蛋白与靶mRNA中的AU富集元件结合,促进其去腺苷酸化和降解。ZFP36L3缺陷小鼠的新生儿存活率降低,但胎盘或存活子代未见明显的形态学改变。Zfp36l3为父源印记基因,对基因表达具有深远的亲本来源效应。对敲除(KO)胎盘mRNA进行RNASeq分析,发现许多转录本受到显著影响,其中部分转录本在来源于KO囊胚的分化滋养层干细胞中降解速率降低。1型转铁蛋白受体mRNA在KO胎盘中意外降低,尽管其稳定性增加。该受体对胎盘从母体循环中摄取铁至关重要,其降低伴随KO胎儿铁储备减少,提示这种宫内缺乏可能在后期生活中产生有害后果。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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