GSE347367:免疫受损患者中预先存在的MT-ND3相关OXPHOS优势单核细胞状态限制疫苗应答

该数据集来自肾移植受者mRNA疫苗接种研究,利用外周血单个核细胞的纵向单细胞转录组与蛋白谱分析,识别与后续疫苗应答相关的接种前免疫状态

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基因组分类GPL246769606疫苗编码
GSE347367: A pre-existing MT-ND3-linked OXPHOS-dominant monocyte state constrains vaccine responsiveness in immunocompromised patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE347367:免疫受损患者中预先存在的MT-ND3相关OXPHOS优势单核细胞状态限制疫苗应答

A pre-existing MT-ND3-linked OXPHOS-dominant monocyte state constrains vaccine responsiveness in immunocompromised patients

该数据集来自肾移植受者mRNA疫苗接种研究,利用外周血单个核细胞的纵向单细胞转录组与蛋白谱分析,识别与后续疫苗应答相关的接种前免疫状态。数据覆盖mRNA-1273发现队列、纵向加强针相关样本及独立的BNT162b2肾移植队列,样本经hashtag oligonucleotides多重化并进行计算HTO去多重化,提供保留细胞水平RNA计数及抗体衍生标签和hashtag测定的患者特异性Seurat对象,可用于研究免疫受损人群疫苗应答的预先免疫状态(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肾移植受者常对mRNA疫苗接种表现出免疫应答受损。本研究采用外周血单个核细胞的纵向单细胞转录组和蛋白谱分析,识别与后续疫苗应答相关的接种前免疫状态。该数据集包括一个mRNA-1273发现队列、纵向加强针相关样本以及一个独立的BNT162b2肾移植队列。多名参与者的样本通过hashtag oligonucleotides进行多重化,随后进行计算HTO去多重化。患者特异性的处理后Seurat对象保留了细胞水平的RNA计数以及可用的抗体衍生标签和hashtag测定。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347367

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 08 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肾移植受者常对mRNA疫苗接种表现出受损的免疫应答。本研究采用外周血单个核细胞的纵向单细胞转录组和蛋白质谱分析,以识别与后续疫苗应答相关的接种前免疫状态。数据集包括一个mRNA-1273发现队列、纵向加强针相关样本,以及一个独立的BNT162b2肾移植队列。多名参与者的样本通过hashtag寡核苷酸进行多重标记,随后进行计算HTO去多重化。患者特异性处理后的Seurat对象保留了细胞水平的RNA计数以及可用的抗体衍生标签和hashtag检测数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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