GSE342694:Zbtb20缺失破坏小鼠耳蜗支持细胞模式与成熟并延长出生后毛细胞再生窗口

研究围绕转录因子 Zbtb20 在小鼠耳蜗发育中的作用展开,涉及支持细胞身份维持、上皮模式与成熟、以及出生后毛细胞再生窗口的延长

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE342694: Loss of Zbtb20 disrupts cochlear supporting cell patterning and maturation and extends the postnatal hair cell regenerative window in mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE342694:Zbtb20缺失破坏小鼠耳蜗支持细胞模式与成熟并延长出生后毛细胞再生窗口

Loss of Zbtb20 disrupts cochlear supporting cell patterning and maturation and extends the postnatal hair cell regenerative window in mice

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE342694_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。研究围绕转录因子 Zbtb20 在小鼠耳蜗发育中的作用展开,涉及支持细胞身份维持、上皮模式与成熟、以及出生后毛细胞再生窗口的延长。数据可用于分析 Zbtb20 缺失对耳蜗感觉上皮基因表达调控的影响,并支持耳蜗类器官与外植体模型中再生潜能相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):耳蜗毛细胞(HC)丢失是人类听力损失的主要原因。在新生小鼠中,HC 可由周围的支持细胞(SC)产生,但听力起始后 HC 不再再生。在此,我们展示转录因子 Zbtb20(其在小鼠中与耳蜗发育和耳聋相关,并且是 Primrose 综合征的致病基因)协调执行 SC 身份维持的基因调控程序,并且在小鼠胚胎发育期间敲除耳蜗感觉上皮中的 Zbtb20 会破坏上皮模式形成和成熟。此外,我们采用耳蜗类器官和器官型外植体模型表明,未成熟的 Zbtb20 KO SC 具有增强的 HC 再生潜能。最后,我们证明出生后急性缺失 Zbtb20 通过调节 Midkine-PTPRZ1 驱动 SC 细胞周期重新进入和类器官形成。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342694

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 01 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342694

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

耳蜗毛细胞(HC)丢失是人类听力损失的主要原因。在新生小鼠中,毛细胞可由周围的支持细胞(SC)产生,但听力起始后毛细胞不再再生。在此,我们展示转录因子Zbtb20——该因子已被证实与小鼠耳蜗发育和耳聋相关,并且是Primrose综合征的致病基因——协调强制维持支持细胞身份状态的基因调控程序,且在小鼠胚胎发育期间敲除耳蜗感觉上皮中的Zbtb20会破坏上皮的模式形成和成熟。此外,我们采用耳蜗类器官和器官型外植体模型证明,未成熟的Zbtb20敲除支持细胞具有增强的毛细胞再生潜能。最后,我们证明出生后急性敲除Zbtb20可通过调节Midkine-PTPRZ1信号通路驱动支持细胞细胞周期再进入和类器官形成,并且急性敲除可在耳蜗外植体中响应毛细胞损伤而驱动毛细胞再生。

这些发现表明Zbtb20是耳蜗感觉上皮发育及支持细胞身份维持的关键调节因子,并为支持细胞成熟在限制再生可塑性中的作用提供了见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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