GSE333689：皮肤-肾脏中性粒细胞轴关联UV暴露与健康及狼疮肾脏血管生成和组织重塑 [RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333689

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数据说明

中性粒细胞被认为参与介导损伤组织与远端器官之间的免疫交互作用，既可促进局部和远端炎症，也可介导组织修复。紫外线（UV）所致皮肤损伤可触发中性粒细胞向肾脏迁移，这可能与系统性红斑狼疮（SLE）中肾炎发作相关。本研究表明，皮肤暴露于紫外线后，健康肾脏中的肾脏中性粒细胞上调促血管生成转录程序，并激活肾脏内皮血管生成及组织重塑过程。配体–受体分析确定Cd177–Pecam1为关键的中性粒细胞–内皮相互作用。与健康对照不同，皮肤暴露于紫外线可刺激狼疮易感MRL/lpr小鼠中Tgfβ和Wnt信号通路的表达。这种组织重塑反应依赖于中性粒细胞。对狼疮性肾炎（LN）肾脏的空间转录组分析显示，组织重塑和促纤维化通路在中性粒细胞富集区域高表达。

在伴有活动性皮肤病的狼疮性肾炎（LN）患者肾脏中，肾内中性粒细胞水平高于肾炎发作时无皮肤受累的患者。此外，在伴有活动性皮肤病（包括日光相关皮疹）的系统性红斑狼疮（SLE）患者中，即使没有狼疮性肾炎，尿中性粒细胞也升高。这些结果支持这样一个模型：紫外线触发的皮肤损伤激活了中性粒细胞介导的皮肤-肾脏轴，从而在健康肾脏与狼疮易感肾脏中促进不同的组织重塑途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。