皮肤-肾脏中性粒细胞轴连接UV暴露与健康及狼疮肾脏血管生成和组织重塑 [scRNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333688

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数据说明

中性粒细胞被认为参与介导受损组织与远端器官之间的免疫交互，既可促进局部和远端炎症，也可介导组织修复。紫外线（UV）所致皮肤损伤可触发中性粒细胞向肾脏迁移，这可能与系统性红斑狼疮（SLE）肾炎发作相关。本研究表明，皮肤暴露于紫外线后，健康肾脏中的肾中性粒细胞上调促血管生成转录程序，并激活肾内皮血管生成及组织重塑过程。配体–受体分析确定Cd177–Pecam1为关键的中性粒细胞–内皮相互作用。与健康对照不同，皮肤暴露于紫外线可刺激狼疮易感MRL/lpr小鼠中Tgfβ和Wnt信号通路的表达。这种组织重塑反应依赖于中性粒细胞。对狼疮性肾炎（LN）肾脏的空间转录组分析显示，组织重塑和促纤维化通路在中性粒细胞富集区域高表达。

在伴有活动性皮肤病的狼疮性肾炎（LN）患者肾脏中，肾内中性粒细胞水平高于肾炎发作时无皮肤受累的患者。此外，在伴有活动性皮肤病（包括日光相关皮疹）的系统性红斑狼疮（SLE）患者中，即使没有狼疮性肾炎，尿中性粒细胞也增多。这些结果支持这样一个模型：紫外线触发的皮肤损伤激活了中性粒细胞介导的皮肤-肾脏轴，从而在健康肾脏与狼疮易感肾脏中促进不同的组织重塑途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。