BALB/cAjcl与BALB/cByJcl小鼠基线及阿霉素给药后第5天肾小球富集RNA-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320498

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含来自两种BALB/c小鼠亚系——BALB/cAjcl（Ajcl）和BALB/cByJcl（ByJcl）——的肾小球富集RNA测序（RNA-seq）数据。肾小球采用基于Dynabeads的灌注法分离。样本采集自未处理（基线）小鼠以及单次静脉注射阿霉素（盐酸多柔比星；10 mg/kg；异氟烷麻醉下经眶后注射）后第5天的小鼠。从分离的肾小球中提取总RNA，仅使用RNA完整性值（RIN）≥ 7.0的样本。RNA-seq文库采用poly(A)选择进行链特异性测序制备，并在Illumina NovaSeq 6000平台上测序，生成2 × 150 bp双端读长（每样本约6 Gb）。初步处理包括质量控制（FastQC）、修剪（Trimmomatic）、使用STAR比对至小家鼠参考基因组（GRCm39），以及使用featureCounts进行基因水平读长汇总。基因水平原始计数矩阵（制表符分隔）作为处理后数据文件提供。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。