Alport谱系患者肾组织全转录组RNA-Seq
该数据集为Alport谱系患者肾活检组织的全转录组RNA测序数据，共93个样本，均呈现与Alport谱系一致的肾小球基底膜改变
基本信息
资源简介
Alport谱系患者肾组织全转录组RNA-Seq
Whole-Transcriptome RNA-Seq of Kidney Tissue from Patients in the Alport Spectrum
该数据集为Alport谱系患者肾活检组织的全转录组RNA测序数据，共93个样本，均呈现与Alport谱系一致的肾小球基底膜改变。数据涵盖转录本丰度、可变剪接及外显子使用信息，重点关注胶原IV相关及其他GBM相关基因。GTEx公开正常肾转录组数据仅作为部分下游分析的外部参考，未包含在本次GEO提交中。该资源可用于研究Alport谱系疾病及相关肾病中肾组织的转录组变异与剪接复杂性（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 09 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Alport综合征涵盖一系列与COL4A3、COL4A4和COL4A5致病性变异相关的肾小球基底膜疾病。本研究对来自93个样本的肾活检组织进行了bulk全转录组RNA测序，这些样本表现出与Alport谱系一致的GBM改变。该数据集包括胶原IV相关及其他GBM相关基因的转录本丰度、可变剪接和外显子使用信息。来自GTEx项目的公开可用正常肾转录组数据被用作选定下游分析的外部参考，但未包含在本次GEO提交中。该数据集为研究Alport谱系疾病及相关肾病患者肾组织中的转录组变异和剪接复杂性提供了资源。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318857
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 27 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Alport综合征包含一系列与COL4A3、COL4A4和COL4A5致病性变异相关的肾小球基底膜疾病。本研究对93份表现出与Alport谱系一致的GBM改变的样本的肾活检组织进行了bulk全转录组RNA测序。该数据集包含IV型胶原相关及其他GBM相关基因的转录本丰度、可变剪接和外显子使用信息。来自GTEx项目的公开正常肾脏转录组数据被用作选定下游分析的外部参考，但未包含在此GEO提交中。该数据集为研究Alport谱系疾病及相关肾病患者的肾脏组织转录组变异和剪接复杂性提供了资源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
