ARC综合征机械生物学近端小管缺陷:VPS33B CRISPR敲除研究

该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对ARC综合征(关节挛缩-肾功能障碍-胆汁淤积)肾脏近端小管缺陷的研究。研究者利用CRISPR技术在人近端小管细胞系RPTEC-TERT1中敲除VPS33B基因,并通过明场成像、免疫染色、RNA测序和细胞脱离实验对敲除细胞进行表征

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基因组分类GPL301739606
GSE298726: Mechanobiological proximal tubular defects in ARC syndrome: A VPS33B CRISPR knockout study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

ARC综合征机械生物学近端小管缺陷:VPS33B CRISPR敲除研究

Mechanobiological proximal tubular defects in ARC syndrome: A VPS33B CRISPR knockout study

该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对ARC综合征(关节挛缩-肾功能障碍-胆汁淤积)肾脏近端小管缺陷的研究。研究者利用CRISPR技术在人近端小管细胞系RPTEC-TERT1中敲除VPS33B基因,并通过明场成像、免疫染色、RNA测序和细胞脱离实验对敲除细胞进行表征。数据可用于分析VPS33B缺失导致的细胞黏附与细胞-基质附着相关转录变化,为理解ARC综合征近端小管病变机制提供转录组层面的参考(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):ARC综合征(关节挛缩-肾功能障碍-胆汁淤积)是一种罕见的常染色体隐性多系统疾病,累及肾脏。该病由VPS33B或VIPAS39基因突变引起。ARC综合征目前无法治愈,患者很少能存活超过一岁。该病的肾脏表现以近端小管功能障碍为特征。本研究对近端小管细胞系RPTEC-TERT1进行CRISPR编辑以敲除(KO)VPS33B表达。利用明场成像、免疫染色、RNA测序和细胞脱离实验对VPS33B-KO细胞进行表征。VPS33B-KO RPTEC-TERT1细胞表现出“剥落”表型和改变的细胞黏附。这一现象连同与细胞黏附相关基因转录的改变,提示VPS33B KO导致细胞-基质附着缺陷。这些发现提供了首个

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30173、9606。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298726

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 03 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

ARC综合征(关节挛缩-肾功能障碍-胆汁淤积)是一种罕见的常染色体隐性遗传多系统疾病,累及肾脏。该病由VPS33B或VIPAS39基因突变引起。ARC综合征目前无法治愈,患者很少能存活超过一岁。该病的肾脏病变以近端肾小管功能障碍为特征。本研究利用CRISPR技术对近端肾小管细胞系RPTEC-TERT1进行基因编辑,敲除(KO)VPS33B表达。通过明场成像、免疫染色、RNA测序和细胞脱附实验对VPS33B-KO细胞进行了表征。VPS33B-KO RPTEC-TERT1细胞表现出“剥落”表型和细胞黏附改变。这一现象连同细胞黏附相关基因转录的改变,提示VPS33B敲除导致细胞-基质附着缺陷。这些发现首次揭示了ARC综合征中近端肾小管功能障碍的病因。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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