对照与盲肠结扎穿刺小鼠肾脏单细胞RNA测序数据集

资源简介

对照与盲肠结扎穿刺小鼠肾脏单细胞RNA测序数据集

GSE298053 是一项针对小鼠肾脏的单细胞 RNA 测序数据集，比较了对照组与盲肠结扎穿刺（cecal ligation and puncture，CLP）造模后肾脏细胞的转录组特征。该数据集由 Jamie R. Privratsky 提交，来源为 NCBI，主题归类为高通量测序表达谱分析，物种为小鼠（10090），平台编号 GPL24247。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE298053_series_matrix.txt.gz。其核心价值在于刻画脓毒症前后肾脏各细胞簇的基因表达差异，为研究脓毒症相关急性肾损伤中的细胞异质性与转录组变化提供原始数据基础。

【数据集背景】

脓毒症可引发急性肾损伤，肾脏内部不同细胞类型在脓毒症发生前后的转录状态变化是理解其损伤机制的重要切入点。该数据集以小鼠为对象，设置对照组与盲肠结扎穿刺（CLP）模型组，利用单细胞 RNA 测序在单细胞分辨率上比较肾脏细胞簇的基因表达差异。源站描述明确指出其关注点为“脓毒症前后肾脏细胞簇中基因表达的差异”，属于泌尿生殖系统疾病领域中与脓毒症肾损伤相关的基础研究数据。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE298053_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。数据主题标签为“Expression profiling by high throughput sequencing”，平台为 GPL24247，物种分类编号为 10090（小鼠）。数据覆盖对照组与 CLP 组小鼠肾脏的单细胞转录组表达信息，可用于比较两组间肾脏细胞簇的基因表达差异。除上述文件与标签信息外，源站未提供更细的细胞数量、基因数量或簇注释信息。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Single cell RNA sequencing of control and cecal ligation-and puncture mouse kidneys”。作者为 Jamie R. Privratsky。源站首次发布时间为 May 23 202（原文如此）。样本分组为对照组与盲肠结扎穿刺组小鼠肾脏，测序策略为单细胞 RNA 测序，属于高通量测序表达谱分析类型。

【适用场景】

该数据适用于脓毒症相关急性肾损伤的基础研究，例如比较脓毒症前后肾脏细胞簇的基因表达差异、探讨肾脏细胞异质性与转录组变化、筛选与脓毒症肾损伤相关的候选基因或细胞亚群。也可作为单细胞转录组分析方法（如聚类、差异表达分析）的练习或验证数据。具体分析目标需结合研究者自身设计，源站未提供预设的分析结论。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE298053_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于文件为系列矩阵形式，读取后应检查样本列与基因行的一致性，并结合平台注释信息进行基因标识映射。源站未提供更详细的分析流程或代码。

【质量与限制】

数据集仅含 1 个文件，源站未提供样本量、测序深度、细胞质控指标等质量参数，也未提供细胞簇注释与统计结果。发布时间在源站记为 May 23 202，年份信息不完整。使用时应自行评估数据质量，并注意单细胞数据固有的稀疏性与批次效应等问题。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

引用时应参考作者 Jamie R. Privratsky 及数据集编号 GSE298053，并注明来源 NCBI。许可信息源站未提供。