SHROOM3缺陷加重阿霉素诱导的肾病并伴随黏着斑解体和应力纤维紊乱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294734

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本RNA测序研究探讨SHROOM3在足细胞功能中的作用及其对肾脏病理生理学的贡献。足细胞是高度分化的上皮细胞，对肾小球滤过屏障的完整性至关重要。本研究探讨了在阿霉素诱导的肾病（一种广泛使用的足细胞损伤和蛋白尿性肾脏疾病实验模型）背景下，SHROOM3缺失如何影响足细胞细胞骨架结构和黏着斑动力学。我们使用RNA测序对人足细胞系进行转录组分析，比较对照组（n=4）和SHROOM3敲低（KD）足细胞（n=4）。我们的目标是确定SHROOM3调控足细胞细胞骨架组织的分子机制和信号通路，特别关注应力纤维形成和黏着斑组装/解聚。该数据集提供了全面的基因表达谱，揭示了SHROOM3缺失如何在肾病进展过程中加剧足细胞损伤、破坏肌动蛋白细胞骨架动力学并损害黏着斑稳定性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。