IgAN患者PBMC单细胞转录组分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285335

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IgA肾病（IgAN）是最常见的原发性肾小球肾炎，是慢性肾脏病的重要病因。尽管既往研究已强调免疫细胞在IgAN发生发展中的作用，但该病临床表现和预后的异质性阻碍了对其具体发病机制的全面理解。本研究旨在识别与IgAN进展相关的循环免疫细胞亚群。研究采集了9例健康对照者和17例经活检证实的IgAN患者的外周血样本，并根据采血时的估算肾小球滤过率（eGFR）将其分为早期组和晚期组。为刻画IgAN特异性免疫细胞图谱及其潜在调控机制，研究采用单细胞RNA测序观察IgAN各组之间不同的免疫细胞图谱和转录组差异。值得注意的是，CD8+ T细胞，尤其是IL-7Rαlow效应记忆细胞，与疾病进展呈显著相关。轨迹分析揭示了不同的CD8+ T细胞发育模式，其中早期组显示出记忆CD8+ T细胞的独特富集。

CD8+ T细胞簇的基因表达谱分析显示其在活化和分化方面存在差异，强调了CD8+ T细胞在IgAN进展中的关键作用。相比之下，CD4+ T细胞和B细胞与疾病进展的相关性有限。本转录组谱分析强调了CD8+ T细胞亚群在IgAN进展中的预后意义。这些发现凸显了其作为治疗靶点的潜力，并为循环免疫细胞在IgAN进展中的作用提供了新的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。