前列腺细胞感染阴道毛滴虫与人型支原体的转录响应
该数据集来自 NCBI GEO(GSE278319),研究前列腺细胞在单独或共生感染阴道毛滴虫与人型支原体后的转录响应。可用于分析两种病原体单独及共生状态对宿主细胞基因表达的影响,比较不同感染条件下的转录差异(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
前列腺细胞感染阴道毛滴虫与人型支原体的转录响应
The transcriptional response of prostate cells to infection with Trichomonas vaginalis and Mycoplasma hominis
该数据集来自 NCBI GEO(GSE278319),研究前列腺细胞在单独或共生感染阴道毛滴虫与人型支原体后的转录响应。数据包含 1 个文件(GSE278319_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱,物种为人类(9606),平台为 GPL24676。可用于分析两种病原体单独及共生状态对宿主细胞基因表达的影响,比较不同感染条件下的转录差异(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):性传播寄生虫阴道毛滴虫常与人型支原体这种专性胞内病原体共生。人型支原体本身是女性生殖道的条件致病菌,与细菌性阴道病相关。本实验旨在鉴定每种病原体单独及共生状态对宿主细胞基因表达的影响。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278319
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 03 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
性传播寄生虫阴道毛滴虫常与专性细胞内病原体人型支原体共生。人型支原体本身是女性生殖道的机会性病原体,与细菌性阴道病相关。本实验旨在识别每种病原体单独及共生时对宿主细胞基因表达的影响。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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