tRNA m1A修饰通过TGF-β通路翻译调控促进良性前列腺增生 [m1A-MAP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272948

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数据说明

良性前列腺增生（BPH）是影响老年男性的一种常见泌尿系统疾病。尽管整体高甲基化已被认为与BPH发病机制相关，但N1-甲基腺苷（m1A）tRNA修饰的具体作用仍不清楚。本研究发现，RNA m1A修饰及其甲基转移酶TRMT61A在BPH组织中显著上调。TRMT61A缺失导致m1A tRNA修饰受损，在体外和体内均引起前列腺细胞增殖和收缩能力下降，并诱导细胞周期阻滞和凋亡。机制上，TRMT61A敲低减少了m1A修饰的tRNA，损害整体翻译并改变特定基因的翻译效率。此外，核糖体图谱分析和RNA测序显示，TRMT61A缺失后翻译效率降低的基因富集于TGF-β信号通路，包括TGFβR1、INHBA、SMAD2、FST和ID2。密码子使用偏好性导致了TRMT61A缺失细胞中翻译效率的差异。

我们的研究揭示了一种新机制，即TRMT61A通过动态m1A tRNA修饰及对密码子依赖性翻译网络的调控，促进BPH进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。