植入肾损伤响应细胞补充促红细胞生成素并保护肾脏 [空间转录组学]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268847

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

贫血对慢性肾脏病（CKD）患者构成危及生命的风险。受损肾脏产生促红细胞生成素（EPO）不足是贫血的主要原因，而EPO缺乏又会进一步加重肾损伤，形成“恶性循环”。本研究通过空间转录组学分析，剖析了受损肾脏内源性EPO信号的变化，并验证了局部给予重组EPO在纠正贫血和肾脏保护方面的双重有益作用。随后，我们构建了一种损伤响应型EPO生产（iREP）元件，用以感知肾脏损伤信号并驱动天然EPO的合成与分泌。将iREP工程化的HEK-293T胚胎肾细胞植入肾内后，小鼠肾脏在感知损伤信号时会自动产生更多EPO，进而增强红细胞量并保护肾脏免受进一步损伤。此外，借助自动化设备，我们从健康供者和CKD患者中克隆了尿液来源的SOX9+上皮细胞（USCs）。

USCs可移植入小鼠肾脏并形成管状结构，这使其成为iREP工程化的替代候选细胞。总之，当前工作提出了一种基于工程化“智能”细胞治疗CKDs的潜在方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。