GSE265897:早期IKKβ依赖的合成代谢与纤维化特征决定血管平滑肌细胞命运及腹主动脉瘤发展

该数据集来自NCBI GEO,包含对ApoE缺陷小鼠肾上腹主动脉在Ang II或生理盐水输注24小时后进行的RNA-Seq表达谱数据,并涉及一种可在血管平滑肌细胞中条件性抑制IKKβ表达的高脂血症小鼠模型

geo
浏览 5
基因组预测GPL1905710090
GSE265897: Early IKKb-dependent anabolic and fibrotic signature governs vascular smooth muscle cells fate and abdominal aortic aneurysm development

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE265897:早期IKKβ依赖的合成代谢与纤维化特征决定血管平滑肌细胞命运及腹主动脉瘤发展

Early IKKb-dependent anabolic and fibrotic signature governs vascular smooth muscle cells fate and abdominal aortic aneurysm development

该数据集来自NCBI GEO,包含对ApoE缺陷小鼠肾上腹主动脉在Ang II或生理盐水输注24小时后进行的RNA-Seq表达谱数据,并涉及一种可在血管平滑肌细胞中条件性抑制IKKβ表达的高脂血症小鼠模型。数据可用于研究腹主动脉瘤早期IKKβ依赖的细胞合成代谢过程(如mTORC1通路激活)及纤维化特征,探索血管平滑肌细胞命运决定机制,并辅助识别腹主动脉瘤的早期分子标志物与潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):腹主动脉瘤(AAA)是一种严重疾病,目前尚无有效的药物治疗。尽管炎症被认为是AAA的关键调节因素,但在疾病确立后靶向炎症通路并不能改善预后。了解最早的分子指标可能有助于阐明AAA的精确生物学靶点和预后标志物。我们使用ApoE缺陷小鼠,在输注Ang II和生理盐水24小时后,对肾上腹主动脉(SRA)进行了RNA-Seq。我们进一步开发了一种独特的高脂血症小鼠模型,其中核因子kappa B激酶亚基beta(IKKβ)抑制剂在血管平滑肌细胞(VSMC)中的表达可以被条件性抑制。RNA-Seq数据揭示了SRA中早期IKKβ依赖的细胞合成代谢过程,包括哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1(mTORC1)通路的激活。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE265897

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 12 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE265897

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

腹主动脉瘤(AAA)是一种严重疾病,目前尚无有效的药物治疗。尽管炎症被认为是AAA的关键调节因素,但在疾病确立后靶向炎症通路并不能改善预后。了解最早的分子指标有助于明确AAA的精确生物学靶点和预后标志物。我们使用ApoE缺陷小鼠,在输注血管紧张素II(Ang II)和生理盐水24小时后,对肾上腹主动脉(SRA)进行了RNA-Seq。我们进一步开发了一种独特的高脂血症小鼠模型,在该模型中,核因子kappa B激酶亚基beta抑制剂(IKKβ)的表达可在血管平滑肌细胞(VSMCs)中被条件性抑制。RNA-Seq数据揭示了SRA中早期IKKβ依赖的细胞合成代谢过程,包括哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1(mTORC1)通路的激活。此外,在暴露于Ang II的小鼠中,VSMCs中Ikbkb基因的缺失显著降低了动脉瘤破裂的发生率。

原位分析进一步证实,VSMCs中IKKβ的缺失与炎症反应减轻及其收缩表型的保持相关。我们的结果强化了VSMCs在快速适应中的关键作用,这种适应导致血管壁发生有害的炎症依赖性重构,并明确了IKKβ在AAA发病机制中一个此前未被认识的合成代谢作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。