MTOPS研究中非那雄胺或多沙唑嗪给药后前列腺组织基因表达变化

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262946

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数据说明

良性前列腺增生（BPH）可能降低患者生活质量，并常导致急性尿潴留和手术干预。尽管已有有效治疗方法，但许多BPH患者对治疗无应答或产生耐药性。为理解BPH治疗耐药的分子决定因素，我们研究了前列腺症状药物治疗（MTOPS）试验中108名参与者前列腺移行区治疗前后的基因表达谱。无监督聚类揭示了以大量基因表达变化为特征的分子亚群，这些基因与对非那雄胺（一种5α-还原酶抑制剂）的耐药性相关。该基因簇内的通路分析发现，非那雄胺给药诱导移行区内脂肪酸代谢、氨基酸代谢、免疫反应、类固醇激素代谢和激酶活性发生变化。我们发现，没有这种转录反应的患者极有可能发生耐药，预计在接受非那雄胺治疗的患者中有33%会出现这种情况。

重要的是，患者对非那雄胺的转录反应与其治疗前的激酶表达相关。此外，我们在转录上有反应的患者中识别出了非那雄胺耐药的新表达特征。与对治疗有反应的患者相比，这些患者在基线时显示出不同的基因表达谱，并且前列腺移行区体积增大。我们的工作提示了非那雄胺治疗耐药的分子机制，这可能有助于良性前列腺增生（BPH）的个性化治疗以及新药开发，以提高患者的药物反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。