小鼠卵母细胞UBE2I的E2 SUMO结合酶与染色质动态及转录沉默数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE218484

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在哺乳动物中，具备减数分裂能力的卵母细胞在卵巢卵泡发生过程中周期性发育。在其发育过程中，停滞于减数分裂前期I的卵母细胞具有高度转录活性，为减数分裂恢复以及母源到合子转变之前的早期胚胎发生做准备。卵泡发生过程中卵母细胞发育缺陷会导致减数分裂缺陷、非整倍体、卵泡闭锁或不能存活的胚胎。SUMO化是一种动态的蛋白质翻译后修饰，对小鼠卵泡发生过程中的卵母细胞发育以及减数分裂成熟的调控至关重要。我们利用Zp3-cre构建了一种新的卵母细胞特异性Ube2i敲除模型，Ube2i是唯一的SUMO E2连接酶，以检验其在生长中的卵巢卵泡中的作用。Ube2i Zp3-cre+雌性小鼠不育，其卵母细胞存在减数分裂进程缺陷，但减数分裂恢复并无缺陷。重要的是，完全生长的卵母细胞并未沉默转录，而是过早激活了合子转录程序。这项工作揭示了UBE2i作为卵母细胞中染色质和转录调控关键协调者的未知功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。