GSE138819：间充质PDGFR-β失调驱动肾脏纤维化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE138819

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肾纤维化的特征在于血小板衍生生长因子受体-β（PDGFR-β）阳性间充质细胞的扩增与活化。为研究PDGFR-β激活的后果，我们利用在肾间充质细胞中特异性激活PDGFR-β的转基因小鼠，建立了一种原发性肾纤维化模型，该模型驱动间充质细胞病理性增殖并向肌成纤维细胞表型转化。这导致了进行性系膜增生性肾小球肾炎、系膜硬化和间质纤维化，并因成纤维细胞产生促红细胞生成素减少而出现进行性贫血。我们采用微阵列技术，比较了野生型动物（Foxd1_wt Pdgfrb_wt）与肾脏中组成性间充质PDGFR-β激活的动物（Foxd1_mt Pdgfrb V536A），以识别PDGFR-β信号传导的靶基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。