GSE113241：免疫刺激剂诱导斑马鱼长效应答及其对病毒感染影响的分析

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数据说明

近年来，先天免疫反应的重要性日益凸显，因为有证据表明，在经过适当的启动方案后，可以获得某种持久且增强的免疫反应。然而，免疫刺激剂的给药时机和方法等多个因素需要仔细考虑。不恰当的方案可能使这些处理成为硬骨鱼免疫系统的双刃剑，导致应激和免疫抑制状态。在本研究中，我们分析了不同刺激物（β-葡聚糖、脂多糖和聚肌胞苷酸）对成年斑马鱼（Danio rerio）中由春季鲤病毒血症病毒（SVCV）诱导的转录组调控的长期影响，以及对该感染所致死亡率的影响。在免疫刺激后35天，发现转录组与对照鱼相比发生了高度改变，这些刺激物也影响了对SVCV攻毒的反应，尤其是在β-葡聚糖的情况下。任何刺激物均未发现对SVCV的保护作用，甚至观察到非显著的更高死亡率，尤其是使用β-葡聚糖时。

然而，在短期（β-葡聚糖预刺激后7天感染）条件下，感染后观察到轻微的保护作用。经β-葡聚糖处理35天后，斑马鱼肾脏的转录组响应显示出与应激和免疫抑制相关的显著反应。感染前后差异表达基因的鉴定似乎表明，长时间免疫刺激具有高能量消耗，这可能是对SVCV缺乏保护的原因。对压力的差异反应、脂质代谢的改变、色氨酸-犬尿氨酸途径以及干扰素-γ信号传导似乎是这一特定反应所涉及的某些机制，这意味着训练免疫的结束和以

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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