先天性肾上腺增生症基因-疾病关联数据集

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份关于类固醇21-羟化酶缺乏症分子诊断的表格文件,涉及CYP21A2基因的基因型分析与基因-疾病关联信息

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2023-06-04 更新
浏览 2
基因组分类ccongenital adrenal hyperplasia (CAH)21-hydroxylase deficiencyCYP21A2 genemolecular diagnosis
Congenital adrenal hyperplasia — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
基因组
大小
0.000028392 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

先天性肾上腺增生症基因-疾病关联数据集

Table_1_Molecular Diagnosis of Steroid 21-Hydroxylase Deficiency: A Practical Approach.docx

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份关于类固醇21-羟化酶缺乏症分子诊断的表格文件,涉及CYP21A2基因的基因型分析与基因-疾病关联信息。内容覆盖经典型与非经典型先天性肾上腺增生症,聚焦基因特异性PCR、假基因-基因嵌合体、基因重复及等位基因丢失等分析要点。可用于辅助理解CAH的分子诊断策略、评估基因型与酶缺陷程度的关联,并支持临床确诊或排除疾病的参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Gene duplications in 21-hydroxylase deficiency: the importance of accurate molecular diagnosis in carrier detection and prenatal diagnosis》发表于 Prenatal Diagnosis(2006),DOI:10.1002/pd.1584。源站首次发布:2022-03-29。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):儿童肾上腺功能不全大多由先天性肾上腺增生症(CAH)引起,这是一种严重的单基因疾病,95%的病例由类固醇21-羟化酶缺乏症(21-OHD,由CYP21A2基因编码)导致。CYP21A2基因分型需要仔细分析,以保证基因特异性PCR、准确定义假基因-基因嵌合体、基因重复以及避免等位基因丢失。一小套已明确的致病性变异能够在有症状患者以及17-羟孕酮结果为临界/阳性的无症状患者中实现高诊断率,以确认或排除该疾病。遗憾的是,该位点的复杂性使其目前难以采用大规模测序的高通量技术。分子变异与酶缺乏程度之间存在的强关联已使得基因

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 28.39 KB。数据集 DOI:10.3389/fendo.2022.834549.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。主题标签:ccongenital adrenal hyperplasia (CAH)、21-hydroxylase deficiency、CYP21A2 gene、molecular diagnosis。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Molecular_Diagnosis_of_Steroid_21-Hydroxylase_Deficiency_A_Practical_Approach_docx/19444724

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Arriba, María; Ezquieta, Begoña (2022). Table_1_Molecular Diagnosis of Steroid 21-Hydroxylase Deficiency: A Practical Approach.docx. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_1_Molecular Diagnosis of Steroid 21-Hydroxylase Deficiency: A Practical Approach.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/34545944"

文件清单

  • Table_1_Molecular Diagnosis of Steroid 21-Hydroxylase Deficiency: A Practical Approach.docx(28.39 KB)

文件总体积 28.39 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

儿童肾上腺功能不全主要由先天性肾上腺增生症(CAH)引起,这是一种严重的单基因疾病,其中95%的病例由类固醇21-羟化酶缺乏症(21-OHD,由CYP21A2基因编码)所致。CYP21A2基因分型需要细致的分析,以确保基因特异性PCR、准确定义假基因-基因嵌合体、基因重复以及避免等位基因丢失。一组少量且明确的致病性变异能够在确认/排除该疾病方面实现高诊断率,不仅适用于有症状的患者,也适用于17-羟孕酮结果为临界值/阳性的无症状患者。遗憾的是,该基因座的复杂性使其目前难以采用大规模测序的高通量技术。分子变异与酶缺乏程度之间存在的密切关系,使遗传学研究得以证明其在预测/分类该疾病临床形式方面的实用性。

关于分子研究的其他值得关注的方面包括:其不受生理变化和分析干扰的影响,在男性单纯男性化型诊断中的实用性,以及其对遗传咨询的固有贡献——考虑到CAH在普通人群中携带者频率较高,这一点尤为重要。CYP21A2基因检测是检测严重等位基因不可替代的工具,不仅适用于经典型患者的家庭成员,也适用于疾病的轻度迟发型患者及夫妇。它在辅助生殖和植入前诊断等领域也有帮助。在专业知识指导下的21-OHD分子诊断,无疑有助于在临床病程的每一个阶段更好地管理该疾病。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fendo.2022.834549.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Molecular_Diagnosis_of_Steroid_21-Hydroxylase_Deficiency_A_Practical_Approach_docx/19444724)。

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