子痫前期胎盘铜铁（cuproptosis–ferroptosis）串扰研究的分析脚本与结果表

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.014v6

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数据说明

本数据包含手稿《子痫前期胎盘中转录组铜-铁串扰汇聚于胎盘功能不全共有的TCA循环抑制，提名PDHB和HSPB1作为情境定义的生物标志物》（投稿于BMC Pregnancy & Childbirth）所有补充表格和图表所依据的分析代码及衍生结果表。内容。scripts/（22个文件）：实现分析工作流程的R和Python脚本——跨八个公共GEO队列（GSE25906、GSE114691、GSE186257、GSE234729、GSE279757、GSE303543、GSE298602、GSE319236）的批量转录组差异表达和ssGSEA评分；WGCNA共表达重复；LASSO特征选择；采用重复5折交叉验证（100次重复，种子42）、留一交叉验证和不重新拟合的外部迁移的逻辑回归诊断建模；校准评估（斜率、截距、大范围校准）；决策曲线分析；与仅基于孕龄的基线进行DeLong比较；单细胞和空间（Visium）佐证；药物-基因相互作用检索；图表生成。

results/（27个文件）：CSV文件，复现每个补充表（表S1-S9）以及中间输出，包括每个队列的ROC坐标、跨队列火山图统计、WGCNA模块-性状关系、决策曲线净获益、空间相关性和药物-基因相互作用。环境。R 4.5.3（base R、pROC、WGCNA）和Python 3.13（numpy、pandas、matplotlib、Pillow、python-docx）。输入数据。主要输入是上文列出的公开可用的GEO系列；原始表达矩阵未在此重新分发。所有数据均来自公开存放的去标识化来源；不包含参与者级别的敏感信息。可重复性说明。脚本保留了作者工作环境的绝对路径，并依赖于未包含在本存放中的中间对象；发布这些脚本是为了记录exa

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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