模拟疾病发展、表达相关药物靶点并响应重定位候选药物的患者来源多囊肾病3D囊肿模型
Alina Meyer,模拟疾病发展、表达相关药物靶点并响应重定位候选药物的患者来源多囊肾病3D囊肿模型[数据集]。主题标签:多囊肾病、3D囊肿模型、患者来源、药物靶点、药物重定位、泌尿生殖系统疾病

基本信息
资源简介
模拟疾病发展、表达相关药物靶点并响应重定位候选药物的患者来源多囊肾病3D囊肿模型
该数据集英文名为“A patient-derived 3D cyst model of polycystic kidney disease that mimics disease development, expresses relevant drug targets and responds to repurposing candidates”,由Alina Meyer贡献,来源于ebi.ac.uk。数据集围绕多囊肾病展开,核心是一种患者来源的3D囊肿模型,该模型能够模拟疾病发展过程、表达相关药物靶点,并对药物重定位候选物产生响应。在分类上,它归属于泌尿生殖系统疾病下的“其他”类别,主题标签涵盖多囊肾病、3D囊肿模型、患者来源、药物靶点、药物重定位以及泌尿生殖系统疾病。该数据集为研究多囊肾病的发病机制、靶点表达特征以及候选药物的重定位评估提供了模型层面的数据资源,适合关注肾脏囊肿性疾病与药物发现的研究者参考使用。
【数据集背景】
多囊肾病是一类以肾脏囊肿形成为特征的泌尿生殖系统疾病,其体外模型对理解疾病发展过程和评估潜在治疗手段具有重要价值。该数据集所对应的研究由Alina Meyer完成,聚焦于建立一种患者来源的3D囊肿模型,并围绕该模型考察其模拟疾病发展、表达相关药物靶点以及对重定位候选药物作出响应等方面的表现。数据集收录于ebi.ac.uk的PRIDE Archive项目PXD056281之下,属于泌尿生殖系统疾病分类中的“其他”类别,主题标签包括多囊肾病、3D囊肿模型、患者来源、药物靶点、药物重定位和泌尿生殖系统疾病。
【数据内容】
该数据集的主题内容为患者来源的多囊肾病3D囊肿模型,涉及疾病发展模拟、相关药物靶点表达以及药物重定位候选物的响应等研究方向。数据集名称本身概括了模型的三项核心特征:模拟疾病发展、表达相关药物靶点、响应重定位候选药物。关于数据集内具体包含的文件类型、样本数量、检测指标、靶点名称、候选药物名称及响应数据的具体数值,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为ebi.ac.uk,源站描述指向PRIDE Archive项目PXD056281,作者为Alina Meyer,数据集以“[Dataset]”形式标注。关于样本采集的具体流程、患者来源信息、模型构建方法、实验平台与检测手段等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于数据集名称与主题标签,该数据集适用于多囊肾病相关研究,尤其是围绕患者来源3D囊肿模型的疾病发展模拟、药物靶点表达分析以及药物重定位候选物评估等场景。其主题标签涵盖泌尿生殖系统疾病,可供关注该疾病领域的研究者作为模型数据资源参考。关于具体适用场景的验证结果或推荐用途,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程或软件工具要求等。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、技术验证或使用限制的说明。使用者需注意,该数据集名称所描述的三项模型特征属于研究主题层面的概括,具体数据表现与适用范围应以源站记录为准。
【引用与许可】
源站描述中给出的引用信息为:Alina Meyer, A patient-derived 3D cyst model of polycystic kidney disease that mimics disease development, expresses relevant drug targets and responds to repurposing candidates [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD056281。关于该数据集的许可条款与使用授权信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD056281
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Alina Meyer, A patient-derived 3D cyst model of polycystic kidney disease that mimics disease development, expresses relevant drug targets and responds to repurposing candidates [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD056281
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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