大肠杆菌中L,D-转肽酶介导的肽聚糖交联及β-内酰胺耐药必需因素数据

β-内酰胺类抗生素的靶点是青霉素结合蛋白(PBPs)的D,D-转肽酶活性,该活性负责合成细菌细胞壁肽聚糖中的4→3交联。由L,D-转肽酶形成的非常规3→3交联最早于四十多年前在大肠杆菌中检测到,但此前尚未发现其合成与任何表型相关

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基因组分类感染性疾病细菌感染抗生素耐药实验数据分子机制表型分析基因调控药物靶点
Data from: Factors essential for L,D-transpeptidase-mediated peptidoglycan cross-linking and β-lactam resistance in Escherichia coli

基本信息

模态
基因组
大小
0.940980365 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

大肠杆菌中L,D-转肽酶介导的肽聚糖交联及β-内酰胺耐药必需因素数据

β-内酰胺类抗生素的靶点是青霉素结合蛋白(PBPs)的D,D-转肽酶活性,该活性负责合成细菌细胞壁肽聚糖中的4→3交联。由L,D-转肽酶形成的非常规3→3交联最早于四十多年前在大肠杆菌中检测到,但此前尚未发现其合成与任何表型相关

Data from: Factors essential for L,D-transpeptidase-mediated peptidoglycan cross-linking and β-lactam resistance in Escherichia coli

【数据集背景】

源站首次发布:2017。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):β-内酰胺类抗生素的靶点是青霉素结合蛋白(PBPs)的D,D-转肽酶活性,该活性负责合成细菌细胞壁肽聚糖中的4→3交联。由L,D-转肽酶形成的非常规3→3交联最早于四十多年前在大肠杆菌中检测到,但此前尚未发现其合成与任何表型相关。本研究表明,L,D-转肽酶YcbB的产生与RelA介导的(p)ppGpp警报素合成增加共同作用,可完全绕过PBPs的D,D-转肽酶活性,并导致广谱β-内酰胺耐药性。因此,YcbB的产生足以将(p)ppGpp的作用从抗生素耐受转变为高水平β-内酰胺耐药性。该观察结果揭示了大肠杆菌中一种新的肽聚糖聚合模式,其依赖于数量出乎意料少的酶活性:除YcbB的L,D-转肽酶活性外,还包括A类PBP1b的糖基转移酶活性和DacA的D,D-羧肽酶活性。

【主题与分类】

主题标签:感染性疾病、细菌感染、抗生素耐药、实验数据、分子机制、表型分析、基因调控、药物靶点。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.t5r8m

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 941.0 MB。

数据说明

β-内酰胺类抗生素的靶点是青霉素结合蛋白(PBPs)的D,D-转肽酶活性,该活性负责合成细菌细胞壁肽聚糖中的4→3交联。由L,D-转肽酶形成的非常规3→3交联最早于四十多年前在大肠杆菌中检测到,但此前尚未发现其合成与任何表型相关。本研究表明,L,D-转肽酶YcbB的产生与RelA介导的(p)ppGpp警报素合成增加共同作用,可完全绕过PBPs的D,D-转肽酶活性,并导致广谱β-内酰胺耐药性。因此,YcbB的产生足以将(p)ppGpp的作用从抗生素耐受转变为高水平β-内酰胺耐药性。该观察结果揭示了大肠杆菌中一种新的肽聚糖聚合模式,其依赖于数量出乎意料少的酶活性:除YcbB的L,D-转肽酶活性外,还包括A类PBP1b的糖基转移酶活性和DacA的D,D-羧肽酶活性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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