基于动态增强CT测量肾功能的改良两室模型数据集

研究纳入 38 例原发性高血压或动脉粥样硬化性肾动脉狭窄患者,采用动态增强 CT 与改良两室模型测量单肾 GFR 和灌注,并以碘他拉酸盐清除率作为参考总 GFR、用常规去卷积算法计算灌注进行验证

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2023-06-05 更新
浏览 2
医学影像回归ARASsingle-kidney GFRtwo-compartment modelDCE-CTiothalamate clearanceEHRenal perfusionblood transit delay
A modified two-compartment model for measurement of renal function using dynamic contrast-enhanced computed tomography

基本信息

模态
医学影像
大小
0.0034701 GB
任务类型
回归
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-05
版本
v1

资源简介

基于动态增强CT测量肾功能的改良两室模型数据集

A modified two-compartment model for measurement of renal function using dynamic contrast-enhanced computed tomography

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLOS ONE(2019 年),包含 3 个文件(1 个 xlsx 数据表与 2 个 tif 图像)。研究纳入 38 例原发性高血压或动脉粥样硬化性肾动脉狭窄患者,采用动态增强 CT 与改良两室模型测量单肾 GFR 和灌注,并以碘他拉酸盐清除率作为参考总 GFR、用常规去卷积算法计算灌注进行验证。数据可用于肾功能定量评估方法学验证、单肾 GFR 与灌注测量及观察者间重复性研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《A modified two-compartment model for measurement of renal function using dynamic contrast-enhanced computed tomography》发表于 PLOS ONE(2019),DOI:10.1371/journal.pone.0219605。源站首次发布:2019-07-10。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:验证并调整一个最初为磁共振成像开发的改良两室模型,用于通过动态增强计算机断层扫描(DCE-CT)测量人体单肾肾小球滤过率(GFR)和灌注。方法:本前瞻性研究经机构审查委员会批准,并获得所有患者的书面知情同意。38 例原发性高血压(EH,n = 13)或动脉粥样硬化性肾动脉狭窄(ARAS,n = 25)患者接受了肾脏 DCE-CT,使用改良两室模型测量 GFR 和灌注。碘他拉酸盐清除率用于测量参考总 GFR,并通过肾血流量将其分配为单肾 GFR。肾脏灌注也使用常规去卷积算法计算。GFR 和灌注的验证以及观察者间重复性,我们

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 3.47 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0219605。

【主题与分类】

源站学科分类:Space Science、Medicine、Cell Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。主题标签:ARAS、single-kidney GFR、two-compartment model、DCE-CT、iothalamate clearance、EH、Renal perfusion、blood transit delay。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Space Science、Medicine、Cell Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_modified_two-compartment_model_for_measurement_of_renal_function_using_dynamic_contrast-enhanced_computed_tomography/8855414

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Jiang, Kai; Ferguson, Christopher M.; Abumoawad, Abdelrhman; Saad, Ahmed; C. Textor, Stephen; O. Lerman, Lilach (2019). A modified two-compartment model for measurement of renal function using dynamic contrast-enhanced computed tomography. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-05,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "pone.0219605.s001.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/16223834"
curl -L -o "pone.0219605.s002.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/16223837"
curl -L -o "pone.0219605.s003.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/16223840"

文件清单

  • pone.0219605.s001.xlsx(275.76 KB)
  • pone.0219605.s002.tif(1.62 MB)
  • pone.0219605.s003.tif(1.57 MB)

文件总体积 3.47 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
验证并调整一种最初为磁共振成像开发的改良双室模型,用于通过动态对比增强计算机断层扫描(DCE-CT)测量人体单肾肾小球滤过率(GFR)和灌注。方法
本前瞻性研究经机构审查委员会批准,并获得所有患者的书面知情同意。38例原发性高血压(EH,n = 13)或动脉粥样硬化性肾动脉狭窄(ARAS,n = 25)患者接受了肾脏DCE-CT检查,使用改良双室模型测量GFR和灌注。采用碘酞酸盐清除率测量参考总GFR,并根据肾血流量将其分配为单肾GFR。还使用传统去卷积算法计算肾脏灌注。GFR和灌注的验证及观察者间可重复性通过Pearson相关和Bland-Altman分析进行。结果
双室模型和碘酞酸盐清除率均检测到,ARAS患者狭窄侧肾脏的GFR低于对侧肾脏和EH肾脏。

通过DCE-CT测量的GFR与碘他拉酸盐清除率显示出高度一致性(r = 0.94,P结论
所提出的双室模型利用DCE-CT忠实再现了对比剂动力学,并可能为测量人单肾GFR及灌注提供可靠工具。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0219605(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_modified_two-compartment_model_for_measurement_of_renal_function_using_dynamic_contrast-enhanced_computed_tomography/8855414)。

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